Rastliny sú neustále vystavované rozličným biotickým a abiotickým stresom. Pri prekonávaní týchto stresových faktorov im pomáhajú prospešné mikroorganizmy. Medzi prospešné mikroorganizmy patria aj baktérie Enterobacter sp. SA187, ktoré dokážu solubilizovať zinok a produkovať siderofori. Enterobacter sp. SA187 u Arabidopsis thaliana indukoval odolnosť voči soľnému stresu. Na interakcií medzi mikroorganizmami a rastlinami sa podieľajú rôzne signálne dráhy vrátane signalizácie sprostredkovanej pomocou mitogénom aktivovaných proteín kináz (MAPK). Rastlinný cytoskelet je dynamická štruktúra hrajúca významnú úlohu pri regulácií tolerancie rastlín voči abiotickým a biotickým stresom, delení buniek, pohybe organel či transporte proteínov. Cieľom tejto diplomovej práce bolo uskutočniť fenotypovú analýzu rastlín Medicago sativa divokého typu Regen SY (RSY) a transgénnych línii SIMKK RNAi, SIMK RNAi a GFP-SIMK po inokulácii s Enterobacter sp. SA187. Ďalším cieľom bolo pozorovanie vplyvu Enterobacter sp. SA187 na dynamiku rastu koreňového systému pri reakcií M. sativa na abiotický stres. Posledným cieľom bola imunohistochemická lokalizácia stresom indukovanej MAPK (SIMK), fosforylovaných MAPK a cytoskeletu v bunkách koreňoch M. sativa počas interakcie s prospešnými mikroorganizmami v podmienkach abiotického stresuPlants are constantly exposed to various biotic and abiotic stresses. Beneficial microorganisms help them overcome these stress factors. Among beneficial microorganisms are bacteria Enterobacter sp. SA187, which can solubilize zinc and produce siderophores. Enterobacter sp. SA187 induced salt stress tolerance in Arabidopsis thaliana. The interaction between microorganisms and plants involves various signaling pathways, including mitogen-activated protein kinase (MAPK)- mediated signaling. The plant cytoskeleton is a dynamic structure playing a significant role in regulating plant tolerance to both abiotic and biotic stresses, as well as cell division, organelle movement, and protein transport. The primary objective of this thesis was to perform phenotypic analysis of Medicago sativa wild type Regen SY (RSY) plants and transgenic lines, including SIMKK RNAi, SIMK RNAi, and GFP-SIMK after inoculation with Enterobacter sp. SA187. Additionally, the study aimed to investigate the effect of Enterobacter sp. SA187 on the dynamics of root system growth in M. sativa under abiotic stress. The final objective was the immunohistochemical localization of stress-induced MAPK (SIMK), phosphorylated MAPK, and cytoskeleton in M. sativa roots during the interaction with beneficial microorganisms under abiotic stress conditions.