Počet záznamů: 1
Mechanismus oprav DNA-proteinových crosslinků u huseníčku rolního
Údaje o názvu Mechanismus oprav DNA-proteinových crosslinků u huseníčku rolního [rukopis] / Veronika Kašková Další variantní názvy Mechanismus oprav DNA-proteinových crosslinků u huseníčku rolního Osobní jméno Kašková, Veronika, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Mechanism of DNA-protein crosslinks repair in Arabidopsis thaliana Vyd.údaje 2021 Fyz.popis 69 (161 577 znaků) : il., tab. Poznámka Ved. práce Eva Tomaštíková Oponent Petra Procházková schrumpfová Dal.odpovědnost Tomaštíková, Eva (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Procházková schrumpfová, Petra, (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova DNA-proteinové crosslinky * zebularin * Arabidopsis thaliana * SMC5/6 komplex * RTEL1 helikáza * DNA-protein crosslinks * zebularine * Arabidopsis thaliana * SMC5/6 complex * RTEL1 helicase Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00263829-170007657.pdf 19 3 MB 20.04.2021 Posudek Typ posudku 00263829-ved-297386209.pdf Posudek vedoucího 00263829-opon-705937420.pdf Posudek oponenta Ostatní přílohy Velikost Popis 00263829-other-833806204.pdf 19.1 KB
DNA-proteinové crosslinky jsou vzhledem ke své variabilitě jedním z nejtoxičtějších, ale nejméně prozkoumaných DNA poškození u rostlin. Za účelem lepšího porozumění opravnému mechanismu byl v laboratoři dr. Pečinky navržen dopředný genetický screen pro identifikaci nových faktorů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků. Díky tomuto dopřednému genetickému screenu jsou vysoce efektivně vybírány nové kandidátní geny, u nichž je analyzováno jejich zapojení do oprav DNA-proteinových crosslinků, a to v závislosti na senzitivitě vybraných rostlin k zebularinu. Zebularin je analog cytidinu, který po inkorporaci do molekuly DNA vytváří kovalentní vazbu mezi DNA methyltransferázou 1 a DNA řetězcem, tím vytváří fyzickou bariéru pro enzymy zprostředkovávající replikaci a transkripci, čímž přímo ohrožuje integritu genomu. Díky dopřednému genetickému screenu bylo již dříve odhaleno, že se oprav DNA-proteinových crosslinků účastní také SMC5/6 komplex, který hraje zásadní roli v udržování stability genomu odstraňováním komplexních DNA struktur. Navíc tento komplex disponuje širokým spektrem dalších funkcí v DNA metabolismu. Nově identifikovaným genem zapojujícím se do oprav DNA-proteinových crosslinků je pak RTEL1. Tato práce je zaměřena na validaci tohoto kandidátního genu, a také na analýzu mechanismu jeho zapojení do oprav poškození DNA, zejména pak na genetickou interakci mezi SMC5/6 komplexem. Analýza byla provedena pomocí dvojitých mutantů vzniklých křížením rostlin deficientních na RTEL1 a na určité podjednotky SMC5/6 komplexu.Due to their variability, DNA-protein crosslinks are one of the most toxic but least studied DNA damage in plants. In order to understand its repair mechanism, the group of Dr. Pečinka designed a forward genetic screen to identify new factors involved in DNA-protein crosslink repair. This allows high efficiency selection of new candidate genes. The involvement of these candidates in DNA-protein crosslink repair is analyzed based, on the sensitivity of selected plants to zebularin. Zebularin is a cytidine analog that, when incorporated into a DNA molecule, forms a covalent bond between DNA methyltransferase 1 and the DNA strand. Thus, zebularine directly compromises genom integrity, by creating a physical barrier to enzymes that mediate replication and transcription. It has previously been revealed that the SMC5/6 complex plays a crucial role in maintaining genome stability by removing complex DNA structures. In addition, this complex provides a wide range of other functions in DNA metabolism. RTEL1 was identified as one of the the new factors involved in DNA-protein crosslink repair. This work aims at validation of this candidate gene, as well as analysing of the mechanism of its involvement in the repair of DNA damage, especially the genetic interaction between the SMC5/6 complex. The analysis was performed using double mutants created by crossing plants deficient in RTEL1 and the subunits of the SMC5/6 complex.
Počet záznamů: 1