Počet záznamů: 1
Počítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami
Údaje o názvu Počítačové simulace Na+/K+-ATPasy a jejích interakcí s malými molekulami [rukopis] / Petra Čechová Další variantní názvy Molekulárně-dynamické simulace Na+/K+-ATPázy v membráně Osobní jméno Čechová, Petra (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Molecular Dynamics Simulations of Na+/K+-ATPase Vyd.údaje 2018 Fyz.popis 106 : il., grafy, schémata, tab. Poznámka Ved. práce Martin Kubala Ved. práce Martin Kubala Dal.odpovědnost Kubala, Martin, 1977- (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Kubala, Martin, 1977- (školitel) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biofyziky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Na+/K+-ATPasa * sodno-draselná pumpa * membránové proteiny * molekulární dynamika * docking * molekulární dokování * flavonolignany * quinolinony * výpočetní biologie * Na+/K+-ATPase * sodium-potassium pump * membrane proteins * molecular dynamics * molecular docking * flavonolignans * quinolinones * computational biology Forma, žánr disertace dissertations MDT (043.3) Země vyd. Česko Jazyk dok. angličtina Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Ph.D. Studijní program Doktorský Studijní program Fyzika Studijní obor Biofyzika kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00196335-583884084.pdf 40 16.3 MB 14.06.2018 Posudek Typ posudku 00196335-ved-421972400.pdf Posudek vedoucího 00196335-opon-820711637.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00196335-prubeh-212767593.pdf 01.09.2009 14.06.2018 30.08.2018 S 2
Výpočetní biologie využívá znalostí struktury proteinu k vytvoření počítačového modelu, který pak slouží jako základ pro zkoumání vztahu mezi jeho strukturou a funkcí. Na+/K+-ATPasa je membránový protein, který udržuje rovnováhu iontů v buňce a je tak nezbytný pro správnou funkci lidského těla. Tato disertační práce se věnuje popisu Na+/K+-ATPasy pomocí dvou výpočetních metod. Molekulární dynamika je využita k popisu iontových cest, pohybu domén a vazbě nukleotidů. Molekulární dokování bylo použito k vysvětlení mechanismu účinku flavonolignanů a quinolinonů na tento protein.Computational biology utilises information of protein structure and build models that are used to study their structure-function relationship. Na+/K+-ATPase is a membrane protein essential to human body by maintaining ion balance in the cells. This thesis studies Na+/K+-ATPase by two computational methods - molecular dynamics to describe ion pathways, domain movements and nucleotide binding, and molecular docking to rationalise the interaction of flavonolignans and quinolinones with this protein.
Počet záznamů: 1