Počet záznamů: 1
Identifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis
Údaje o názvu Identifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis [rukopis] / Adéla Nedavašková Další variantní názvy Identifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis Osobní jméno Nedavašková, Adéla, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Identification of new genes involved in DNA-protein crosslink repair in Arabidopsis Vyd.údaje 2022 Fyz.popis 41 s. : il., grafy, tab. Poznámka Ved. práce Eva Tomaštíková Oponent Jitka Jemelková Dal.odpovědnost Tomaštíková, Eva (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Jemelková, Jitka, (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Arabidopsis thaliana * DNA-proteinové crosslinky * zebularin * Arabidopsis thaliana * DNA-protein crosslinks * zebularine Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00275263-412791520.pdf 18 2.2 MB 06.05.2022 Posudek Typ posudku 00275263-ved-149561042.pdf Posudek vedoucího 00275263-opon-917851128.pdf Posudek oponenta
DNA-proteinové crosslinky představují pro buňky vysoce toxické poškození v podobě kovalentního spojení proteinů s řetězcem DNA. Pokud nejsou včas opraveny, může docházet k mutacím a buněčné smrti. Naštěstí si buňky vytvořily efektivní cesty, kterými dokážou obnovit původní strukturu genetického materiálu a zachovat tak integritu genomu. Pro identifikaci genů, které hrají roli v opravách DNA-proteinových crosslinků, byl ve vědecké skupině doc. Aleše Pečinky navržen dopředný genetický screen, který využívá EMS-mutagenizované populace rostlin huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana). K indukci DNA-proteinových crosslinků sloužil zebularin - cytidinový analog, jehož schopností je zachytávat enzym METYLTRANSFERÁZU 1 na DNA a vytvářet tak sterické zábrany pro jiné enzymy spjaté s DNA. Rostliny, ve kterých vlivem mutace došlo k inaktivaci kauzálního genu, vykazovaly díky ošetření zebularinem výraznou redukci kořene. Pomocí těchto postupů byly nově objeveny kandidátní linie 21B-5 a 21B-30, k analýzám charakterizujícím efekt mutace však v rámci experimentální části bakalářské práce sloužila pouze linie 21B-5.DNA-protein crosslinks represent highly toxic damage to cells in the form of a covalent linkage of proteins with a DNA strand. If not properly repaired, DNA-protein crosslinks can lead to mutation and cell death. Fortunately, cells have evolved effective DNA repair pathways to restore the original structure of genetic material and thus maintain their genomic integrity. To identify genes that play a role in DNA-protein crosslink repair, the research group of Doc. Aleš Pečinka designed a forward-directed genetic screen that uses EMS-mutagenized populations of the thale cress (Arabidopsis thaliana). Zebularine - a cytidine analog was used to induce DNA-protein crosslinks, because of its ability to covalently trap METHYLTRANSFERASE 1 on the DNA and thus create steric hindrance to other DNA-related enzymes. Plants in which the causal gene was inactivated by the mutation showed significant root reduction after the zebularine treatment. This allowed me to find candidate lines 21B-5 and 21B-30, but only line 21B-5 was used for analysis identifying and also characterizing the causal mutation as a factor involved in DNA-protein crosslink repair.
Počet záznamů: 1