Krňávková, Petra,
Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu trubkonosí u čápa bílého (Ciconia ciconia) [rukopis] / Petra Krňávková. -- 2021. -- VII. + 49 s : tab. -- Ved. práce Petr Nádvorník. -- Oponent Miloslav Kitner. -- Abstrakt: Tato bakalářská práce se zabývá hledáním polymorfních mikrosatelitních lokusů u čápa bílého (Ciconia ciconia) pomocí cross-species PCR amplifikace. Teoretická část se věnuje fylogenezi a charakteristice řádu brodiví a čeledi čápovití, dále popisu čápa bílého, jeho rozšíření a rozmnožování. V další kapitole jsou charakterizovány mikrosatelity a v neposlední řadě jednotlivé polymorfní mikrosatelity u druhů z řádu trubkonosí, které byly cross-species PCR testovány u čápa bílého. Experimentální část se zaobírá cross-species PCR amplifikací s použitím 213 párů primerů, kdy 207 pocházelo od zástupců z řádu trubkonosí, 5 od zástupců z řádu dlouhokřídlí a 1 z řádu pěvci. Tyto mikrosatelitní lokusy byly testovány na genomické DNA 6 nepříbuzných jedinců čápa bílého. Pomocí cross-species PCR amplifikace jsem nalezla 18 polymorfních mikrosatelitních lokusů s počtem alel od dvou do šesti. Mikrosatelitní lokus Paequ2 neposkytl žádný produkt. Zbývajících 194 lokusů poskytlo produkt monomorfní.. -- Abstrakt: This bachelor thesis deals with the search for polymorphic microsatellite loci in white storks (Ciconia ciconia) using cross-species PCR amplification. The theoretical part deals with the phylogeny and characteristics of the order of Ciconiiformes and family Ciconiidae, further there is a description of the white stork, its distribution and reproduction. The next chapter characterizes microsatellites and polymorphic microsatellites in species from the order of the Procellariiformes, which were cross-species PCR tested in white storks. The experimental part deals with cross-species PCR amplification using 213 pairs of primers, 207 of which were from species of the order Procellariiformes, 5 from species of the order Charadriiformes and 1 from the order Passeriformes. These microsatellites were tested on the genomic DNA of 6 unrelated white storks individuals. Using cross-species PCR amplification, I found 18 polymorphic microsatellite loci with number of alleles ranged from 2 to 6. Microsatellite loci Paequ2 did not amplified product. The remaining 194 loci gave the product monomorphic.
Nádvorník, Petr. Kitner, Miloslav. Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky
Čáp bílý. mikrosatelity. cross-species PCR amplifikace. Ciconia ciconia. trubkonosí. White stork. microsatellites. cross-species PCR amplification. Ciconia ciconia. Procellariiformes. bakalářské práce
(043)378.22