Nukleární magnetická rezonanční spektroskopie je unikátním nástrojem pro sledování molekulárních interakcí v roztoku a jako taková si získala nezastupitelné místo v oblasti detekce a charakterizace interakcí nízkomolekulárních látek s většími makromolekulami. Experimenty z pohledu ligandu jsou hojně využívány v rámci vývoje léčiv a mohou tak přispět k vyšší efektivitě v této oblasti. Tato práce se zaměřuje na zavedení metody, s využitím nukleární magnetické rezonance, pro rychlé a efektivní testování velkého množství biologicky aktivních látek, které jsou na místním pracovišti de-novo syntetizovány. Jako cílový protein byl vybrán AtCKX2, který je ze všech CKX isoforem nejvíce studovaným a také nejvíce zastoupeným proteinem v Arabidopsis thaliana.Nuclear magnetic resonation is a unique tool to study molecular interactions in solution, which gained an irreplaceable place for detection and characterization of interactions between small organic compounds and larger macromolecules. Ligand-based NMR experiments are using in drug discovery, where are making the research more effective. This diploma thesis is focused on application of nuclear magnetic resonance spectroscopy for rapid and effective testing of large number small molecules and their interactions with protein. As a target protein was chosen AtCKX2, which is the most studied and the most abundant CKX's isoforms in Arabidopsis thaliana.