Počet záznamů: 1
Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií
Údaje o názvu Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií [rukopis] / Andrea Chalachanová Další variantní názvy Výskyt oxacilináz u vybraných Gram-negatívnych baktérií Osobní jméno Chalachanová, Andrea (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Prevalence of oxacillinases in selected Gram-negative bacteria Vyd.údaje 2019 Fyz.popis ix, 60 s. (132 025 znakov) + 1 CD ROM Poznámka Oponent Ondřej Holý Ved. práce Patrik Mlynárčik Dal.odpovědnost Holý, Ondřej (oponent) Mlynárčik, Patrik, (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova beta-laktámové antibiotiká * Gram-negatívne baktérie * PCR * oxacilinázy * primery * antimikrobiálna rezistencia * beta-lactams antibiotics * Gram-negative bacteria * PCR * oxacilinases * primers * antimicrobial resistance Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. slovenština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00225317-350605896.pdf 22 2.1 MB 25.04.2019 Posudek Typ posudku 00225317-ved-846327904.pdf Posudek vedoucího 00225317-opon-836884586.pdf Posudek oponenta
Predkladaná diplomová práca sa zaoberá štúdiom oxacilináz (OXA) u vybraných druhov Gram-negatívnych baktérií, a to Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae a Acinetobacter baumannii. Teoretická časť práce je venovaná základnej charakteristike patogénov s dôrazom na čeľaď Enterobacteriaceae, definícii a klasifikácii beta-laktámových antibiotík, typom bakteriálnych obranných mechanizmov a charakteristike jednotlivých tried beta-laktamáz, predovšetkým beta-laktamáz triedy D. K skríningu oxacilináz u vybraných druhov baktérií bola použitá PCR amplifikácia s využitím špecifických párov oligonukleotidov navrhnutých pomocou bioinformatického softvéru Geneious. U klinických izolátov K. pneumoniae a E. cloacae bol potvrdený výskyt blaOXA-1-like génov. Klinický izolát A. baumannii bol pozitívny na enzýmy OXA-23-like, OXA-51-like, OXA-58-like, OXA-211-like a OXA-228-like. Výsledky štúdie potvrdili špecifickosť navrhnutých párov oligonukleotidov. Zistené bolo, že navrhnuté primery disponujú schopnosťou špecificky detegovať 90,3 % zo všetkých oxacilináz popísaných v BLDB databáze. In silico analýzou sekvencií reprezentatívnych oxacilináz bol potvrdený výskyt zachovaných aminokyselinových motívov.The submitted diploma thesis deals with the study of oxacillinases (OXA) in selected species of Gram-negative bacteria, namely Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae and Acinetobacter baumannii. The theoretical part of thesis is devoted to basic characteristics of pathogens with an emphasis on Enterobacteriaceae family, definition and classification of beta-lactam antibiotics, types of bacterial defensive mechanisms and characteristics of individual classes of beta-lactamases, especially class D beta-lactamases. Screening of oxacillinases of selected bacterial species was performed by PCR amplification using specific pairs of oligonucleotides designed by bioinformatics software Geneious. Genes blaOXA-1-like have been found in clinical isolates of K. pneumoniae and E. cloacae. Clinical isolate of A. baumannii has been positive for OXA-23-like, OXA-51-like, OXA-58-like, OXA-211-like and OXA-228-like enzymes. The study results confirmed the specificity of the designed oligonucleotide pairs. It was found that the designed primers possess the ability to specifically detect 90.3 % of all oxacillinases described in the BLDB database. The presence of conserved amino acid motifs was confirmed by in silico analysis of sequences of representative members of oxacillinases.
Počet záznamů: 1