Diplomová práce se zabývá aplikací modelu CZ-GLOBIO na území České republiky. Model CZ-GLOBIO v této práci slouží jako nástroj k posouzení degradace biotopů pomocí pěti vybraných driverů. Model CZ-GLOBIO je aplikován na celou Českou republiku v regionálním a v lokálním měřítku. První je provedena aplikace modelu CZ-GLOBIO v regionálním měřítku s využitím datové sady Corine LC 2012 a následně v lokálním měřítku s daty Kombinované vrstvy biotopů. Model CZ-GLOBIO vychází z teoretického a praktického základu obecného modelu GLOBIO v3.0 pro posouzení biodiverzity. Hlavním předmětem této práce je tedy vyřešit především datovou a aplikační adaptaci obecného modelu GLOBIO v3.0 k vyhodnocení biodiverzity pro podmínky České republiky. Dílčími úkoly je příprava dat pro jednotlivé drivery a následný výpočet indexu, který odpovídá poměru původního počtu druhů v dané lokalitě.This thesis deals with application of CZ-GLOBIO model for a whole area of the Czech Republic. CZ-GLOBIO model is used as a tool for assessment of degradation of biotopes with five chosen drivers. CZ-GLOBIO model is applied for the whole area of the Czech Republic in two main scales in regional and in local. Firstly, it is conducted application of CZ-GLOBIO model in regional scale with use of data from Corine LC 2012. Then it is carried out with data Kombinovaná vrstva biotopů in local scale. CZ-GLOBIO model is theoretically and practically derived from world-known GLOBIO v3.0 model for assessment of biodiversity. Thus the main aim of this thesis is to solve the adaptation of data and application of universal GLOBIO v3.0 model for an assessment of biodiversity for conditions in the Czech Republic. Partial task is a preparation data for each driver and subsequent calculation of index which correlates to number of mean species abundance.