Počet záznamů: 1
Identifikace chromozómů v karyotypu čiroku halepského
Údaje o názvu Identifikace chromozómů v karyotypu čiroku halepského [rukopis] / Magdaléna Malurová Další variantní názvy Identifikace chromozómů v karyotypu čiroku halepského L Osobní jméno Malurová, Magdaléna, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Chromosome identification in karyotype of sorghum halepense L Vyd.údaje 2020 Fyz.popis 66 s. : tab. Poznámka Ved. práce Miroslava Karafiátová Oponent Zdeněk Kubát Dal.odpovědnost Karafiátová, Miroslava (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Kubát, Zdeněk, (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Sorghum * Sorghum halepense * karyotyp * identifikace chromozómů * FISH * Sorghum * Sorghum halepense * chromosome identification * karyotype * FISH Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00236001-913755842.pdf 31 1.4 MB 25.05.2020 Posudek Typ posudku 00236001-ved-415393364.pdf Posudek vedoucího 00236001-opon-309353971.pdf Posudek oponenta
Čirok halepský (Sorghum halepense (L.) Pers.) je planá rostlina blízce příbuzná zemědělsky významné obilovině čiroku dvoubarevnému (Sorghum bicolor (L.) Moench). Zatím není k dispozici karyotyp čiroku halepského založený na molekulárních markerech, ačkoliv by to mohlo do budoucna ulehčit další výzkum genomu tohoto druhu. Cílem této práce bylo získat cytogenetické markery pro identifikaci chromozómů pomocí metody fluorescenční in situ hybridizace. Pro identifikaci chromozómů bylo navrženo 8 repetitivních sond, z nichž jedna byla chromozómově specifická a další 3 repetice tvořily patern na dvou chromozómových párech. Chromozómově specifické byly také sondy pro 5S a 45S ribozomální DNA. Dále bylo navrženo 20 jednokopiových sond kolineárních k distálním oblastem chromozómů čiroku dvoubarevného. 10 z nich na chromozómech čiroku halepského vytvořilo patern na dvou chromozómech a 10 hybridizovalo nespecificky. V rámci práce byla získána také centromerická sonda, která hybridizovala do všech centromer chromozómů čiroku halepského ovšem s dosti specifickým hybridizačním paternem. Během analýzy byla dále pozorována přítomnost fragilních satelitů, které u tohoto druhu nebyly dosud popsány.Sorghum halepense (L.) Pers. is a wild relative of Sorghum bicolor (L.) Moench which is agronomically significant cereal. The molecular karyotype of Sorghum halepense has not been available so far, although it could considerably facilitate genomic studies of this species. The aim of this study was to develop chromosome specific cytogenetic markers and identify the individual chromosomes in karyotype using fluorescence in situ hybridization. 8 repetitive probes were designed for chromosome identification. Out of them, only one turned up to be chromosome specific and three other repeats revealed specific pattern on two chromosome pairs. In addition, 45S and 5S ribosomal DNA hybridized on single chromosome pair. Further, 20 single-copy probes collinear with distal regions on chromosome of Sorghum bicolor were designed. The signals of 10 single-copy probes were detected on two chromosome pairs while remaining single-copy probes hybridized non-specifically. Additionally, centromeric probe was developed. Interestingly, it showed highly diverse pattern on individual chromosomes. During the analysis, the phenomena of fragile satellites was observed. This is the first time that fragile sites have been demonstrated in Sorghum genera.
Počet záznamů: 1