Téma zvyšujících se koncentrací skleníkových plynů v atmosféře rezonuje napříč společností. Avšak jejich emisím z přírodních ekosystémů se nevěnuje tolik pozornosti, jako emisím z antropogenních zdrojů. V této diplomové práci byla řešena problematika přirozených emisí metanu z tůní ve 3 aluviálních oblastech ČR. Na celkem 25 lokalitách z oblasti Tvrdonice, Litovelské Pomoraví a Poodří byly měřeny hodnoty difúzních emisí metanu, koncentrace metanu ve vodě a vybrané fyzikálně-chemické parametry. Výzkum probíhal v roce 2022 v období od května do září. Pro zachycení variability podmínek v tůních byly všechny tůně navštíveny dvakrát během jarního a letního období. Emise byly měřeny pomocí přenosného analyzátoru skleníkových plynů Los Gatos Research Inc. Na všech lokalitách byl zjištěn pozitivní tok metanu do atmosféry. Medián celkového denního toku metanu pro všechny tůně dohromady nabýval hodnot 0,002?0,024 mol CH4 m-2 d-1; mezi studovanými oblastmi však nebyly nalezeny žádné signifikantní rozdíly. Ze sledovaných fyz.-chem. parametrů signifikantně souvisely s toky metanu koncentrace fosforečnanů, pH a zastínění tůní. Práci lze nicméně považovat za primární východisko pro další studie emisí metanu z aluviálních oblastí ČR, které toto téma prohloubí a pomohou tím k celkovému lepšímu pochopení globálních emisí metanu.The issue of rising concentrations of greenhouse gases in the atmosphere resonates across society. However, their emissions from natural ecosystems do not receive as much attention as emissions from anthropogenic sources. In this thesis, the issue of natural methane emissions from pools in 3 alluvial areas of the Czech Republic was addressed. The values of diffuse methane emissions, methane concentration in water and selected physicochemical parameters were measured at a total of 25 sites in the Tvrdonice, Litovelské Pomoraví and Poodří regions. The research was conducted in 2022 in the period from May to September. To capture the variability of conditions in the pools, all pools were visited twice during the spring and summer seasons. Emissions were measured using a portable greenhouse gas analyzer from Los Gatos Research Inc. A positive flux of methane to the atmosphere was detected at all sites. The median total daily methane flux for all pools combined was 0.002?0.024 mol CH4 m-2 d-1; however, no significant differences were found between the study areas. Of the phys.-chem. parameters, phosphorus, pH and pond shading were significantly related to methane fluxes. Nevertheless, the work can be considered as a primary starting point for further studies of methane emissions from alluvial areas of the Czech Republic, which will deepen this topic and thus contribute to an overall better understanding of global methane emissions.