Počet záznamů: 1
Identifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie
Údaje o názvu Identifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie [rukopis] / Lubomír Machalla Další variantní názvy Identifikace peptidů navázaných na MHCI molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie Osobní jméno Machalla, Lubomír, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Identification of MHCI bound peptides using a mass spectrometry Vyd.údaje 2022 Fyz.popis 64 : il., grafy, schémata, tab. Poznámka Ved. práce Kateřina Zachová Oponent Ján Gurský Dal.odpovědnost Zachová, Kateřina, (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Gurský, Ján (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Dendritické buňky * Spike protein * receptor vázající doména * hlavní histokompatibilní komplex * peptid * hmotnostní spektrometrie * Dendritic cells * Spike protein * receptor binding domain * major histocompatibility complex * mass spectrometry * peptide Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biochemie Studijní obor Biochemie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00271348-331749280.pdf 47 2 MB 26.04.2022 Posudek Typ posudku 00271348-ved-259316585.pdf Posudek vedoucího 00271348-opon-588281765.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00271348-prubeh-183515587.pdf 19.10.2020 26.04.2022 23.05.2022 1 Hodnocení známkou
Dendritické buňky jsou buňky imunitního systému, které propojují jeho vrozenou a získanou část. Patří mezi tzv. profesionální antigen prezentující buňky, které dokáží pohltit antigen pomocí fagocytózy a následně takový antigen rozložit na peptidové fragmenty. Tyto fragmenty poté dendritická buňka vystavuje na svém povrchu pomocí MHC molekul. V rámci diplomové práce byla věnována pozornost MHC I molekule a peptidům nacházejícím se na této molekule. K dendritickým buňkám byl přidán rekombinantní RBD protein pocházející z viru SARS-CoV-2. Pomocí imunoafinitní chromatografie byl komplex MHC I - peptid izolován z buněčného lyzátu. Následovalo štěpení komplexu MHC I - peptid trypsinem a kapalinová chromatografie, kde byly odseparovány jednotlivé peptidy. Identifikace peptidů byla provedena pomocí hmotnostní spektrometrie. Celkově analýza byla provedena 3x z důvodu optimalizace metody. Získané aminokyselinové sekvence peptidů byly následně porovnány pomocí databáze UniProt.Dendritic cells are cells of the immune system that connect its innate and adaptive parts. Dendritic cells belong to the group called professional antigen-presenting cells, which can absorb the antigen by phagocytosis and subsequently break down the antigen into peptide fragments. These fragments are then displayed on the cell surface using MHC molecules. Within the diploma thesis, attention was paid to the MHC I molecule and peptides bound on this molecule. To the dendritic cells was added recombinant RBD protein derived from SARS-CoV-2. The MHC I - peptide complex was isolated from the cell lysate by immunoaffinity chromatography. After that complex MHC I - peptide was digested by trypsin and peptides from the complex were separated by liquid chromatography. To the identification of peptides was used mass spectrometry. The analysis was performed 3 times to optimize the method. The obtained amino acid peptide sequences were compared using the UniProt database.
Počet záznamů: 1