Gastrointestinální stromální tumory jsou nejčastějšími mesenchymálními nádory trávicího traktu, s patrnou diferenciací podél linie intersticiálních Cajalových buněk. Tyto nádory nyní vzbuzují zvláštní zájem vzhledem k jejich dobré reakci na cílenou terapii tyrozinkinázovými inhibitory. V rámci této bakalářské práce byla studována exprese proteinů RBPMS2, hMLH1, hMSH2, p53 a p21 pomocí nepřímé dvoustupňové imunohistochemie ve vzorcích gastrointestinálních stromálních tumorů. Experimentálně získané hodnoty exprese těchto proteinů byly korelovány se stupněm rizika rekurence, progresí tumoru, aplikovanou terapií a velikostí tumoru za použití neparametrického statistického testu Mann-Whitney. Výsledky této práce potvrdily souvislost mezi overexpresí proteinů p53, p21 a zvýšeným rizikem progrese gastrointestinálních stromálních tumorů (p53: p = 0,022; p21: p = 0,044). Čímž se podpořila možnost využití p21 jako nového nezávislého prognostického markeru umožňujícího stanovit malignitu gastrointestinálních stromálních tumorů. Dále byla analyzována exprese proteinů hMLH1 a hMSH2, podílejících se na reparaci DNA. A byla zjištěna signifikantní korelace mezi expresí hMLH1, rizikem rekurence (p = 0,027) a velikostí tumoru (p = 0,013) související s vysokou mitotickou aktivitou maligních gastrointestinálních stromálních tumorů. V rámci souboru testovaných vzorků nebyl prokázán signifikantní vztah mezi expresí RBPMS2 a rizikem rekurence (p = 0,520). Předpokládané využití RBPMS2 ke stanovení prognózy pacientů s gastrointestinálními stromálními tumory tedy nebylo potvrzeno. Výsledky ale podpořily použití RBPMS2 jako nového diagnostického markeru gastrointestinálních stromálních tumorů.Gastrointestinal stromal tumours are the most common mesenchymal neoplasms of the gastrointestinal tract with a noticeable differentiation along the line of the interstitial cells of Cajal. These tumours now arouse particular interest, because of their good response to the targeted therapy by tyrosine kinase inhibitors. As a part of this bachelor's thesis expression of proteins RBPMS2, hMLH1, hMSH2, p53 and p21 was studied by indirect two-step immunohistochemistry which was done in histological tissue sections of gastrointestinal stromal tumours. The experimentally obtained values of the expression of these proteins were correlated with the degree of risk of recurrence, tumour progression, applied therapy and tumour size by using Mann-Whitney non-parametric statistical test. The results of this study confirmed the correlation between overexpression of p53, p21 and an increased risk of progression of gastrointestinal stromal tumours (p53: p = 0.022; p21: p = 0.044). Thus support the possibility of using p21 as a new independent prognostic marker for determining malignancy of gastrointestinal stromal tumours. Furthermore, the expression of proteins hMLH1 and hMSH2, which are involved in DNA repair, was analysed. A significant correlation was found between expression of hMLH1 and the risk of recurrence (p = 0.027) and tumour size (p = 0.013), which is related with a high mitotic activity of malignant gastrointestinal stromal tumours. In the set of analysed tissue sections the significant correlation between the expression of RBPMS2 and the risk of recurrence was not proved (p = 0.520). The intended use of the RBPMS2 for determining the prognosis of patients with gastrointestinal stromal tumours had not been confirmed. However, the results supported the use of RBPMS2 as a new diagnostic marker of gastrointestinal stromal tumours.