Předmětem diplomové práce je analýza motivačního systému organizace. Tato analýza vychází ze základních teorií motivace se zaměřením na pracovní motivaci, její aspekty a složky, které mají výrazný vliv na zefektivnění pracovního výkonu jedince a také na spokojenost zaměstnance. Ve výzkumné části této práce byl analyzován motivační systém společnosti Aukro s.r.o., jeho fungování a složky. Z této analýzy motivačního systému byly postupně vybrány jednotlivé oblasti motivování, které byly rozděleny do kategorií, a na základě těchto kategorií byl sestaven dotazník, který zjišťoval míru spokojenosti zaměstnanců s jednotlivými oblastmi motivačního systému společnosti. Data získaná prostřednictvím dotazníku vlastní konstrukce byla následně vyhodnocena pomocí statistické analýzy dat. Výzkumu se zúčastnilo 90% zaměstnanců společnosti. Z výsledků průzkumu vyplývá, že motivační systém společnosti má drobné nedostatky, které se týkají zejména vnímání spravedlnosti v hodnocení. Dalším nedostatkem se ukázala být informovanost o nepeněžních odměnách a jejich rozsah. Na základě těchto zjištěných nedostatků byla navržena opatření, která by mohla vést k zlepšení dané oblasti motivačního systému a tím k zefektivnění motivování zaměstnanců.The object of the thesis is an analysis of organisation's motivation system. The analysis is based on the fundamental theories of motivation with the aim at work motivation, its aspects and elements, which have a substantial influence on streamlining work performance of individuals and their satisfaction. There is a research of the motivation system of company Aukro, including system functions and components in the research part of the thesis. The motivation components have been picked out of the analysis and divided into categories. A questionaire has been put together based on these categories, with the aim to determine the degree of employee satisfaction with the areas of the company's motivation system. The data obtained with this questionaire was subsequently evaluated with the help of statistic data analysis. 90% of the employees participated on the questionaire. The results imply that the company's motivation system is challanged with small defects that concern perception of the employee appraisal righteousness. Another drawback is that employees are not familiar with the non-financial benefits. Proceedings have been suggested based on the found defects. These proceedings are aimed at improving problematic parts of the motivation system and thus improve employee motivation.