Počet záznamů: 1  

Identifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis

  1. Údaje o názvuIdentifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis [rukopis] / Adéla Nedavašková
    Další variantní názvyIdentifikace nových genů zapojených v opravách DNA-proteinových crosslinků u Arabidopsis
    Osobní jméno Nedavašková, Adéla, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názIdentification of new genes involved in DNA-protein crosslink repair in Arabidopsis
    Vyd.údaje2022
    Fyz.popis41 s. : il., grafy, tab.
    PoznámkaVed. práce Eva Tomaštíková
    Oponent Jitka Jemelková
    Dal.odpovědnost Tomaštíková, Eva (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Jemelková, Jitka, (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Arabidopsis thaliana * DNA-proteinové crosslinky * zebularin * Arabidopsis thaliana * DNA-protein crosslinks * zebularine
    Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses
    MDT (043)378.22
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulBc.
    Studijní programBakalářský
    Studijní programBiologie
    Studijní oborMolekulární a buněčná biologie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00275263-412791520.pdf172.2 MB06.05.2022
    PosudekTyp posudku
    00275263-ved-149561042.pdfPosudek vedoucího
    00275263-opon-917851128.pdfPosudek oponenta

    DNA-proteinové crosslinky představují pro buňky vysoce toxické poškození v podobě kovalentního spojení proteinů s řetězcem DNA. Pokud nejsou včas opraveny, může docházet k mutacím a buněčné smrti. Naštěstí si buňky vytvořily efektivní cesty, kterými dokážou obnovit původní strukturu genetického materiálu a zachovat tak integritu genomu. Pro identifikaci genů, které hrají roli v opravách DNA-proteinových crosslinků, byl ve vědecké skupině doc. Aleše Pečinky navržen dopředný genetický screen, který využívá EMS-mutagenizované populace rostlin huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana). K indukci DNA-proteinových crosslinků sloužil zebularin - cytidinový analog, jehož schopností je zachytávat enzym METYLTRANSFERÁZU 1 na DNA a vytvářet tak sterické zábrany pro jiné enzymy spjaté s DNA. Rostliny, ve kterých vlivem mutace došlo k inaktivaci kauzálního genu, vykazovaly díky ošetření zebularinem výraznou redukci kořene. Pomocí těchto postupů byly nově objeveny kandidátní linie 21B-5 a 21B-30, k analýzám charakterizujícím efekt mutace však v rámci experimentální části bakalářské práce sloužila pouze linie 21B-5.DNA-protein crosslinks represent highly toxic damage to cells in the form of a covalent linkage of proteins with a DNA strand. If not properly repaired, DNA-protein crosslinks can lead to mutation and cell death. Fortunately, cells have evolved effective DNA repair pathways to restore the original structure of genetic material and thus maintain their genomic integrity. To identify genes that play a role in DNA-protein crosslink repair, the research group of Doc. Aleš Pečinka designed a forward-directed genetic screen that uses EMS-mutagenized populations of the thale cress (Arabidopsis thaliana). Zebularine - a cytidine analog was used to induce DNA-protein crosslinks, because of its ability to covalently trap METHYLTRANSFERASE 1 on the DNA and thus create steric hindrance to other DNA-related enzymes. Plants in which the causal gene was inactivated by the mutation showed significant root reduction after the zebularine treatment. This allowed me to find candidate lines 21B-5 and 21B-30, but only line 21B-5 was used for analysis identifying and also characterizing the causal mutation as a factor involved in DNA-protein crosslink repair.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.