Počet záznamů: 1
Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu
Údaje o názvu Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu [rukopis] / Jakub Bělíček Další variantní názvy Studium genové exprese genů vybraných aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu Osobní jméno Bělíček, Jakub, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Study of gene expression of selected aldehyde dehydrogenases in maize and moss Vyd.údaje 2019 Fyz.popis 60 s. (83 168 znaků) : grafy, schémata, tab. Poznámka Oponent David Zalabák Ved. práce Radka Končitíková Dal.odpovědnost Zalabák, David (oponent) Končitíková, Radka (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Aldehyddehydrogenasa * genová exprese * abiotický stres * Physcomitrella patens * Zea mays * qRT-PCR * fylogenetická analýza * Aldehyde dehydrogenase * gene expression * abiotic stress * Physcomitrella patens * Zea mays * qRT-PCR * phylogenetic analysis Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biochemie Studijní obor Biochemie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00234277-945579233.pdf 92 1.9 MB 13.05.2019 Posudek Typ posudku 00234277-ved-911118242.pdf Posudek vedoucího 00234277-opon-754691600.pdf Posudek oponenta
Tato bakalářská práce se zabývá vlivem abiotického stresu na změnu genové exprese genů aldehyddehodrogenas u kukuřice (Zea mays) a mechu (Physcomitrella patens) s využitím kvantitativních PCR experimentů v kombinaci s reverzní transkripcí RNA (qRT-PCR). Izolovaná RNA byla purifikována a transkribována do cDNA, jež sloužila jako základ pro qPCR experimenty. Pro detekci amplifikace byly použity FAM-TAMRA sondy. Naměřené hodnoty cyklu prahu (CT) byly přepočítány na počet kopií genů vztažený na ng RNA. Byla rovněž provedena fylogenetická analýza enzymů aldehyddehydrogenas v kukuřici a mechu. Stres vyvolaný přídavkem soli zapříčinil zvýšení exprese u genů PpALDH7 a PpALDH10, dále potom u ZmALDH7 a ZmALDH12 v kombinaci s přídavkem aminokyselin a všech ZmAMDH v kombinaci s přídavkem putrescinu. Tyto enzymy pravděpodobně v rostlinách zodpovídají za adaptaci na zvýšenou koncentraci solí v půdním roztoku. Vlivem dehydratace pak došlo k zesílení exprese u PpALDH2A, PpALDH10 a PpALDH21, což poukazuje na jejich osmoprotektivní roli. Dehydratace naopak vyvolala snížení exprese u PpALDH2B.This bacherol thesis deals with the effect of abiotic stress on difference in gene expresssion of aldehyde dehydrogenases genes in maize (Zea mays) and moss (Physcomitrella patens) using PCR experiments with the combination of reverse transcription of RNA (qRT-PCR). Isolated RNA was purified and transcribed into cDNA, the basis for qPCR assay. FAM-TAMRA probes were used for detection of amplification. The measured cycle treshold (CT) values were converted to the number of gene copies relative to ng of RNA. The phylogenetic analysis of aldehyde dehydrogenases genes in maize and moss was solved too. Salt addition-induced stress caused increase of expression of PpALDH7 and PpALDH10, followed by ZmALDH7 and ZmALDH12 in combination with addition of amino acids and all ZmAMDHs in combination with putrescine addition. The enzymes are likely to be responsible for salt-caused stress adaptation in these plants. Dehydratation-caused stress upregulated expression of PpALDH2A, PpALDH10 and PpALDH21, suggesting their osmoprotective role. Conversely, dehydratation-caused stress induced a decrease of expression of PpALDH2B.
Počet záznamů: 1