Počet záznamů: 1
Metabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze
Údaje o názvu Metabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze [rukopis] / Dana Dobešová Další variantní názvy Metabolomická analýza HeLa buněk defektních v purinové de novo syntéze Osobní jméno Dobešová, Dana (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Metabolomic analysis of HeLa cells defective in purine de novo synthesis Vyd.údaje 2019 Fyz.popis 90 s. (120 314 znaků) : tab. + Seznam zkratek metabolitů Poznámka Oponent Jitka Široká Ved. práce Lucie Mádrová Dal.odpovědnost Široká, Jitka (oponent) Mádrová, Lucie (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova metabolismus a transport purinů * technika CRISPR/Cas9 * metabolomika * statistická analýza * identifikace metabolitů * purine metabolism and transport * CRISPR/Cas9 technique * metabolomics * statistical analysis * metabolite identification Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biochemie Studijní obor Biochemie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00225280-903973941.pdf 0 5.8 MB 31.12.2999 Posudek Typ posudku 00225280-ved-465992325.pdf Posudek vedoucího 00225280-opon-817334621.pdf Posudek oponenta
Tato diplomová práce byla zaměřena na analýzu metabolomického profilu HeLa buněčných linií upravených technikou CRISPR/Cas9 v rámci jednotlivých kroků purinové de novo syntézy (PDNS). Jedná se o první modely lidských buněk pro studium jak známých, tak i potenciálních poruch této metabolické dráhy. Dosud byly popsány dvě dědičné metabolické poruchy PDNS - deficit ADSL a AICA-ribosidurie. Pro experiment byla zvolena kombinace necílené a cílené metabolomické analýzy, která byla provedena pomocí ultraúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní detekcí. Získaná data byla statisticky vyhodnocena a biochemicky interpretována. K významným metabolitům všech defektních linií v porovnání s kontrolou se řadily především meziprodukty PDNS. Dále byly pozorovány změny v hladinách purinů, pyrimidinů, acylovaných karnitinů a metabolitů účastnících se jednouhlíkového metabolismu.This diploma thesis was focused on the analysis of metabolomic profile of CRISPR/Cas9 genome edited HeLa cell lines deficient in individual steps of purine de novo synthesis (PDNS). These are the first human cell models for the study of both known and potential disorders of this metabolic pathway. To date, two inherited metabolic disorders of PDNS have been identified - ADSL deficiency and AICA-ribosiduria. Combination of non-targeted and targeted metabolomic analysis was performed using ultra high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry. The obtained data were statistically evaluated and biochemically interpreted. Compared to controls, PDNS intermediates were among the most significant metabolites of all defective cell lines. Furthermore, changes were found in the levels of purines, pyrimidines, acylcarnitines and metabolites involved in one-carbon metabolism.
Počet záznamů: 1