Počet záznamů: 1  

Softvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek

  1. Údaje o názvuSoftvérová aplikácia pre MALDI MS intaktných buniek [rukopis] / Simona Martikánová
    Další variantní názvySoftwarová aplikace pro MALDI-MS intaktních buněk
    Osobní jméno Martikánová, Simona, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názSoftware application for MALDI-TS of intact cells
    Vyd.údaje2021
    Fyz.popis68 : il., tab.
    PoznámkaVed. práce Marek Šebela
    Oponent Lucie Šimková
    Dal.odpovědnost Šebela, Marek, 1971- (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Šimková, Lucie, (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova MALDI-TOF * spektrum * kontrola * hmotnostná spektrometria * proteín * proteóm * algoritmus * teoretická hmotnosť * sinica * Python * MALDI-TOF * spectrum * control * mass spectrometry * protein * proteome * algorithm * theoretical mass * cyanobacteria * Python
    Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses
    MDT (043)378.22
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.slovenština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulBc.
    Studijní programBakalářský
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBioinformatika
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00261397-677642237.pdf233.7 MB20.05.2021
    PosudekTyp posudku
    00261397-ved-251817896.pdfPosudek vedoucího
    00261397-opon-706646366.pdfPosudek oponenta
    Ostatní přílohyVelikostPopis
    00261397-other-245288549.zip24.8 MB
    00261397-other-778964107.zip27.5 MB
    00261397-other-567005937.zip61.5 MB

    Hmotnostnou spektrometriou MALDI-TOF intaktných buniek mikroorganizmov sa dajú získať fingerprintové spektrá proteínov obsahujúce charakteristické diagnostické signály. So znalosťou úplnej proteómovej sekvencie je možné priradiť na základe molekulovej hmotnosti jednotlivé signály konkrétnym proteínom. Náplňou práce je pripraviť algoritmus umožňujúci spracovanie proteómových sekvencií vo FASTA formáte do hodnôt molekulových hmotností proteínov a porovnať ich s experimentálnou sadou diagnostických signálov odčítaných zo spektier. Zvolením tolerancie pre zhodu hodnôt teoretických a experimentálnych hmotností, budú tieto signály priradené konkrétnym proteínom. Ďalej bude navrhnutý algorimus, ktorý umožňuje porovnávať signály dvoch spektier medzi sebou a vybrať tie, ktoré sú podobné a rozdielne.With MALDI-TOF mass spectrometry of intact cells of microorganisms, fingerprints spectra of proteins containing characteristic diagnostic signals can be acquired. With knowledge of complete proteomic sequence, individual signals are assigned to particular proteins based on molecular mass. The scope of work is to prepare algorithm enabling processing of proteomic sequences in FASTA format into molecular weight and compare them with an experimental set of diagnostic signals obtained from the spectra. These signals will be assigned to particular protein by selecting a tolerance for matching of theoretical and experimental mass values. Next designed algorithm will compare signals of two different spectra with each other and select similiar and different signals.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.