Počet záznamů: 1
Dynamika vybraných RNA motivů
Údaje o názvu Dynamika vybraných RNA motivů [rukopis] / Pavel Polakovič Další variantní názvy Dynamika vybraných RNA motivů Osobní jméno Polakovič, Pavel (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Dynamics of Selected RNA Motives Vyd.údaje 2009 Fyz.popis 75 s. : il., grafy, tab. + CD ROM Poznámka Ved. práce Michal Otyepka Dal.odpovědnost Otyepka, Michal, 1975- (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Banáš, Pavel (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Ribozym viru hepatitidy D * samoštěpící virová RNA * acidobazická reakce * mechanismus obecné zásadý * mechanismus obecné kyseliny * The hepatitis delta virus (HDV) ribozyme * iral RNA self-cleavage * acid-base reaction * general base mechanism * general acid mechanism Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Chemie Studijní obor Management v chemii kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 74041-120511781.pdf 58 4.6 MB 11.05.2009
Ribozym viru hepatitidy D katalyzuje samoštěpící virovou RNA pomocí acidobazické reakce, ve které je zahrnut nukleotid C75 a nejméně jeden kovový ion. Tato bakalářská práce se zabývá MD simulacemi a pozorováním divokého typu HDV ribozymu, GC mutantu a A+C mutantu s protonovaným či deprotonovaným nukleotidem C75. Sledoval jsem vodíkové vazby a okupanci Na+ iontů v aktivním místě.The hepatitis delta virus (HDV) ribozyme catalyzes viral RNA self-cleavage through general acid-base chemistry in which an active-site cytidine and at least one metal ions are involved. This Bachelor thesis deals with MD simulations and observation of wild type of HDV ribozyme, GC mutant and A+C mutant with protonated or unprotonated C75. I observed H-bond in active site and occupation of Na+ ions in active site.
Počet záznamů: 1