Počet záznamů: 1
Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis
Údaje o názvu Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis [rukopis] / Lucie Šimková Další variantní názvy Komparativní analýza subgenomů Pachycladon exilis Osobní jméno Šimková, Lucie (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Comparative analysis of Pachycladon exilis subgenomes Vyd.údaje 2019 Fyz.popis 51 Poznámka Ved. práce Jan Bartoš Oponent Radim Čegan Dal.odpovědnost Bartoš, Jan (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Čegan, Radim, (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova Celogenomová duplikace * kolinearita * polyploidie * Pachycladon exilis * Whole genome duplication * polyploidy * collinearity * Pachycladon exilis Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biochemie Studijní obor Bioinformatika kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00226199-871924200.pdf 88 1.3 MB 13.05.2019 Posudek Typ posudku 00226199-ved-209513080.pdf Posudek vedoucího 00226199-opon-216101190.pdf Posudek oponenta
Pachycladon exilis je mesopolyploidní druh endemický na Novém Zélandě, který vznikl z allopolyploidního předka před asi 2 miliony let. V rámci diplomové práce byla provedena komparativní analýza P. exilis s Arabidopsis lyrata, byly porovnávány subgenomu v rámci P. exilis a následně provedena komparativní analýza se sestaveným transkriptomem Crucihimalaya himalaica. Podařilo se vytvořit metodiku pro identifikaci kandidátních subgenomů P. exilis a jejich přiřazení k rodičovským genomům.Pachycladon exilis is a mesopolyploid species, endemic in New Zealand with an allopolyploid origin. This diploma thesis focuses on a comparative analysis of P. exilis and Arabidopsis lyrata, a comparison of P. exilis subgenomes and comparative analysis with Crucihimalaya himalaica. The thesis provide a methodology for identification of candidate subgenomes of P. exilis and their assignment to a potential evolutionary parental genomes.
Počet záznamů: 1