Diplomová práca "Colná správa ako správca daní v Českej republike" sa zaoberá charakteristikou Colnej správy ČR, organizačnou štruktúrou colných orgánov a ich kompetenciami. Predovšetkým sa venuje problematike správy daní zverených Colnej správe ČR. Po úvodnom definovaní základných pojmov je podrobne opísaná hierarchia colnej správy a zmeny, ktoré v nej nastali od 1.1.2013, spolu s autorkiným hodnotením zavedených zmien. Hlavná časť práce je venovaná správe daní Colnou správou ČR a to konkrétne čiastočnej správe DPH a výhradnej správe spotrebných a ekologických daní. Sú zadefinované jednotlivé dane a právomoci colnej správy v tejto sfére. Samostatná kapitola sa venuje delenej správe ako ďalšej z funkcií Colnej správy ČR. Nakoniec je popísaný systém správy ciel a daní v Slovenskej republike a prevedená komparácia so systémom v ČR.The thesis Customs Administration as a tax administrator in Czech Republic deals with characterization of The Czech Customs Administration, its structure and jurisdiction, mainly with the tax administration. Basic concepts are defined first. Changes in organizational structure of The Czech Customs Administration after 1st January 2013 are described in second chapter, together with author´s evaluation of these changes. Main part of the thesis deals with partially administration of VAT and exclusive administration of consumer and ecological taxes. Concrete taxes and competences of The Czech Customs Administration in this area are defined. One chapter is devoted to split administration as a new task of The Czech Customs Administration. Last chapter describes system of customs and taxes administration in Slovak Republic and compares it to the system in Czech Republic.