Diplomová práce popisuje finanční kontrolu a interní audit, kvalifikační předpoklady pro výkon profesí finanční kontroly a interního auditu, požadavky stanovené právními předpisy a nastavení systému vzdělávání. Zabývá se vztahem mezi kontrolou a interní auditem, také rozdíly mezi těmito profesemi, rozdíly v nastavení kvalifikačních předpokladů pro výkon obou profesí a nastavením systému vzdělávání v profesi finanční kontrola a interní audit v České republice. Dále následuje analýza fungování nastaveného systému finanční kontroly v ČR za období 2005 - 2009 se zaměřením na problematiku stanovení kvalifikačních předpokladů a nastaveného systému vzdělávání ve dvou profesích systému finanční kontroly u územních samosprávných celků. Závěr diplomové práce obsahuje návrh obsahu zkoušky zvláštní odborné způsobilosti pro auditory.The first part of the diploma thesis describes controlling (financial audit and internal audit), qualification requirements for positions in the fields of financial and internal audit, legal requirements and setting of the system of education for these positions. It defines relationships between financial audit and internal audit, differences in qualification requirements for these positions and describes the system of education for the professions of financial and internal audit in the Czech Republic. In the second part can be found the analysis of practical experience with the present system of controlling in the Czech Republic in 2005 - 2009, specifically the experience with setting of qualification requirements and with defined educational system of education in the two professions in controlling in self-governing units. The draft of the test for the Special Professional Competence for auditors is the last part of the thesis.