Diplomová práce se zabývá studiem mikroklimatu na vytyčených transektem, jež jsou vedeny skrz ekoton, v povodí řeky Trkmanky. Na transektech probíhal od dubna 2008 do dubna 2009 diskrétní monitoring vybraných faktorů mikroklimatu - teploty vzduchu, rychlosti proudění vzduchu a relativní vlhkosti vzduchu - v okolí ekotonů, jež představovaly přechodnou zónu mezi lesním a travním společenstvím. Pro sběr dat měřených třemi ručními anemometry, byl vytvořen elektronický formulář. V rámci vyhodnocení dat byla vytvořena série grafů, tabulek a map, jež zachycují průběh mikroklimatických poměrů v jednotlivých částech transektu - lesní části, ekotonu a travní části. Součástí práce je i automatizované vyhodnocení zápoje lesní vegetace za použití ArcView GIS 3.x. V závěru práce jsou vyřčeny hypotetické závěry, jež plynou z monitoringu.This thesis is focused on the variability monitorin of the chosen microclimate factors in the ecotone's neighbourhoods. The main aim was to measured an air temperature, a wind speed and an air humidity in the eight demarcated transects which go through ecotones in Trkmanka's basin. The measurement were done from April 2008 to April 2009. The measurements were provided using three anemometers and the gathering data were written to e-form in a PDA. The enclosures of this thesis were visualized by series of graphs, tables and maps.