Počet záznamů: 1
Kvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimeru methylovaných páru basí nukleových kyselin v plynné fázi
Údaje o názvu Kvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimeru methylovaných páru basí nukleových kyselin v plynné fázi [rukopis] / Adam Pecina Další variantní názvy Kvantově chemické vypočty termodynamických charakteristik tvorby dimerů methylovaných párů basí nukleových kyselin v plynné fázi Osobní jméno Pecina, Adam (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Quantum chemical investigation of thermodynamic characteristics of formation of methylated DNA basis in vacuo Vyd.údaje 2009 Fyz.popis 52 s. (60591 znaků) : grafy, tab. + CD ROM Poznámka Ved. práce Pavel Hobza Dal.odpovědnost Hobza, Pavel, 1946- (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Jurečka, Petr (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova kvantová chemie * 1-methyluracil dimer * termodynamické charakteristiky * methylated uracil dimer * High-level wave function and Density functional theory calculations * thermodynamical analyze Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Chemie Studijní obor Biofyzikální chemie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 94465-784453700.pdf 0 1.2 MB 31.12.2999
Práce se zabývá srovnáním vysoce přesných kvantově mechanických výpočtů interakčních energií třinácti různých konformací systému 1-methyluracil dimeru, jakožto reprezentativního systému párů basí nukleových kyselin. Termodynamická analýza charakterizuje vzájemnou souhru enthalpie a entropie na vytváření preferovaných konformací systému.Theoretical analysis of the formation of 1-methyluracil dimer was performed. Stabilization energies of 13 different conformations were evaluated at a very high ab initio level by complete basis set limit calculations. In this work we compare accurate interaction energies estimated at CCSD(T)/CBS level with Density functional theory calculations DFT-D/BLYP/TZVP, DFTD/tpss/LP and with calculations of semiempirical methods SCC-DFTB and PM6-DH. All interaction energies were corrected for basis set superposition error (BSSE) with use of counterpoise correction. The thermodynamic characteristics were calculated using rigid rotor-harmonic oscillator-ideal gas approximations. Interaction enthalpie at 0 K were observed by including the zero point energies. Gibbs energies at various temperatures were calculated to include entropy influence. The present calculations allow us to make more general conclusions concerning the interplay of enthalpy and entropy in stabilizing DNA base pairs in vacuo.
Počet záznamů: 1