Počet záznamů: 1
Polymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia)
Údaje o názvu Polymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia) [rukopis] / Eva Burianová Další variantní názvy Polymorfní DNA mikrosatelity u čápa bílého (Ciconia ciconia) Osobní jméno Obručová, Eva (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Polymorphic DNA microsatellites in White Stork (Ciconia ciconia) Vyd.údaje 2009 Fyz.popis 53 s. (12 592 znaků) + 1 CD ROM Poznámka Ved. práce Petr Nádvorník Dal.odpovědnost Nádvorník, Petr (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Kučerová, Lenka (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova čáp bílý * mikrosatelity * cross-species amplifikace * white stork * microsatellites * cross-species amplification Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Signatura Čár.kód Lokace Dislokace Info BP-KBB/075 (PřF-KBO) 3134510607 PřF-Holice PřF, Knihovna Holice - sklad pouze prezenčně
Mikrosatelity jsou krátké úseky DNA, které se skládají z tandemově se opakujících jednotek. V dnešní době patří mezi nejpoužívanější genetické markery. Díky svým jedinečným vlastnostem jsou vhodnými nástroji pro populačně-genetické analýzy, studium příbuzenských vztahů a určování paternity. Tato práce se zabývá hledáním nových polymorfních mikrosatelitových markerů pro čápa bílého (Ciconia ciconia). Pro hledání byla zvolena metoda PCR amplifikace s použitím cross-species primerů taxonomicky příbuzných druhů. Získané amplikony se následně separovaly pomocí elektroforézy v 6% polyakrylamidovém gelu. Celkem bylo touto metodou otestováno 167 párů primerů, které již dříve poskytovaly polymorfní produkt u ptáků z řádu brodivých (Ciconiiformes), plameňáků (Phoenicopteriformes), potápek (Podicipediformes), veslonohých (Pelecaniformes), vrubozobých (Anseriformes), tučňáků (Spehnisciformes), a jeden pár primerů od savců z řádu sudokopytníků (Artiodactyla). Testováním bylo nalezeno 20 polymorfních mikrosatelitových lokusů, u nichž byla zoptimalizována teplota annealingu PCR reakce. U dvou párů mikrosatelitových lokusů bylo zjištěno, že se jedná o ortologní mikrosatelity (páry lokusů Eru07, Eru09 a WS? 17, WS? 18). Nakonec tedy bylo u čápa bílého získáno 18 nezávislých polymorfních mikrosatelitových lokusů.Microsatellites are short DNA segments composed of tandem repeat units. At present they constitute the most widely employed type of genetical markers. Owing to their unique features they are suitable instruments for population-genetic analyses and studies of kinship and parentage. The aim of this bachelor thesis was to obtain new polymorphic microsatellite markers for white stork (Ciconia ciconia). A PCR amplification method using cross-species primers of taxonomically related species was utilized for this purpose. The obtained PCR products were subsequently separated by electrophoresis in 6% polyacrylamide gel. Overall 167 pairs of bird primers, which had previously been providing PCR polymorphic product for orders Ciconiiformes, Phoenicopteriformes, Podicipediformes, Pelecaniformes, Anseriformes, Spehnisciformes and a pair of mammal primers for order Artiodactyla were tested by this method. Twenty polymorphic microsatellite loci have been discovered by this method. The PCR annealing temperature of each locus has been optimized. However, two pairs of the microsatellite loci have manifested themselves in the tests as orthologues microsatellites (loci Eru07, Eru09 and WS? 17, WS? 18). Therefore 18 independent polymorphic microsatellite markers for white stork have been obtained in the end.
Počet záznamů: 1