Práce se zabývá dvěma poddruhy Saxifraga rosacea vyskytujícími se na území České republiky, S. rosacea subsp. sponhemica a S. rosacea subsp. steinmannii, přičemž druhý z nich je endemitem ČR. Na vzorcích získaných ze studovaných lokalit byla provedena analýza metodou průtokové cytometrie a morfometrická analýza. Na základě analýzy metodou průtokové cytometrie byly definovány dvě skupiny podle rozdílné velikosti genomu; s menší velikostí genomu (3,06-3,64 pg) a s větší velikostí genomu (4,13-4,57 pg). K druhé skupině náleží pouze populace v okolí Semil, řazené k subsp. steinmannii, zbylé populace náleží ke skupině s menší velikostí genomu bez ohledu na udávaný poddruh. Morfometrická analýza potvrdila důležitost znaků na listech na úkor jejich odění. Provedené mnohorozměrné analýzy poukazují na morfologickou separaci rostlin s větší velikostí genomu a zároveň indikují morfologickou přechodnost zbylých rostlin řazených subsp. steinmannii k subsp. sponhemica. Zjištěnou nápadnou heterogenitu v populacích endemického poddruhu lze považovat za první impulz k důkladnějšímu taxonomickému studiu S. rosacea agg. na území střední Evropy.This thesis is focused on two subspecies of Saxifraga rosacea occurring in the Czech Republic, S. rosacea subsp. sponhemica and S. rosacea subsp. steinmannii, the second is endemic to the Czech Republic. Flow cytometry and morphometric analysis were performed on the samples obtained from the studied locations. Based on flow-cytometric analysis, two groups according different genome sizes were defined; with a smaller genome size (3,06-3,64 pg) and with a larger genome size (4,13-4,57 pg). The second group includes only populations around Semily town, classified as subsp. steinmannii, the rest of the populations belongs to the group with a smaller genome size, regardless of the reported subspecies. Morphometric analysis confirmed the importance of characters on the leaves at the expense of their hairiness. The performed multivariate analyses imply the morphological separation of plants with a larger genome size and at the same time indicate that the remaining plants classified as subsp. steinmannii as the morphological transition to subsp. sponhemica. The observed heterogeneity in the populations of the endemic subspecies can be considered as the first impulse for a more thorough taxonomic study of S. rosacea agg. in the area of Central Europe.