Počet záznamů: 1  

Měření aktivity enzymů pomocí hmotnostní spektrometrie MALDI-ToF

  1. Údaje o názvuMěření aktivity enzymů pomocí hmotnostní spektrometrie MALDI-ToF [rukopis] / Jan Strnad
    Další variantní názvyMěření aktivity enzymů pomocí hmotnostní spektrometrie MALDI-ToF
    Osobní jméno Strnad, Jan, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názMeasuring enzyme activity using MALDI-ToF mass spectrometry
    Vyd.údaje2023
    Fyz.popis107 s. (195 000 znaků) : il., grafy, schémata, tab.
    PoznámkaOponent Lenka Luhová
    Ved. práce Marek Šebela
    Dal.odpovědnost Luhová, Lenka (oponent)
    Šebela, Marek, 1971- (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova MALDI ToF * enzymová aktivita * aminoxidasa * Pisum Sativum * měření aktivity * MALDI ToF * enzyme activity * amine oxidase * Pisum Sativum * measurement of activity
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiochemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00280679-143491721.pdf04.4 MB25.04.2023
    PosudekTyp posudku
    00280679-ved-244141720.pdfPosudek vedoucího
    00280679-opon-262468967.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00280679-prubeh-772657425.pdf14.10.202125.04.202323.05.2023AHodnocení známkou

    Cu-dependentní aminoxidasy jsou enzymy, jež se účastní mnoha důležitých biologických procesů, mezi něž patří například regulace buněčného růstu, dělení, programované buněčné smrti a odezvy na stresory v prostředí. Přirozenými substráty jsou např. putrescin, kadaverin a spermidin. Aktivita aminoxidas je obvykle měřena spektrofotometrickými, radiometrickými, elektrochemickými či fluorimetrickými metodami. Cílem této práce bylo vytvořit metodu měření aktivity pomocí MALDI ToF hmotnostní spektrometrie na základě signálů substrátu a produktu naměřených se vzorky reakční směsi. Pro tento účel byla použita aminoxidasa purifikovaná ze semenáčků hrachu setého (Pisum sativum). Pomocí metody, jež využívala -kyano-4-hydroxyskořicovou kyselinu s přídavkem cetrimoniumbromidu jako matrici, byly určeny kinetické parametry kcat a Km pro oxidační deaminaci vybraných substrátů, a to na základě závislosti poměrů intenzit signálů produktu a produktu plus substrátu na koncentraci substrátu. Výsledky byly porovnány s paralelním měřením pomocí spektrofotometrické metody využívající spřažené reakce s křenovou peroxidasou a guajakolem a diskutovány s použitím údajů z literatury a databáze BRENDA. Bylo zjištěno, že metoda poskytuje výsledky přesné, jež však nemusejí být správné. Hodnoty Km řádově souhlasily se spodními hranicemi rozsahů uváděných v literatuře, oproti srovnávacímu spektrofotometrickému měření byly nižší. Byl navržen postup zdokonalení metody. Mezi výhody metody patří nízká spotřeba vzorku a náklady na spotřební materiál a to, že na rozdíl od metod používajících MALDI ToF malých molekul bez využití cetrimoniumbromidu nevyžaduje specifický poměr matrice a analytu. Mezi nevýhody patří to, že metoda je založena na relativní kvantifikaci a že může poskytovat horší výsledky při vysokých koncentracích substrátu.Cu-dependent amine oxidases are enzymes, that are part of many fundamental biological processes, among which belong for example regulalation of cell growth, division, programmed cell death and of reactions to enviromental stressors. Examples of natural substrates are putrescine, cadaverine and spermidine. Activity is usually measured using spectrophotometric, radiometric, electrochemical or fluorimetric methods. The aim of this thesis was to create a method of activity measurement using MALDI ToF mass spectrometry based on signals of substrate and product measured with samples of reaction mixture. For this purpose was used amine oxidase purified from garden pea (Pisum sativum) seedlings. Using a method, that utilizes -cyano-4-hydroxycinnamic acid with added cetrimonium bromide as matrix, kinetic parameters kcat a Km were measured for oxidative deamination of selected substrates, based on the dependence of ratio of intensities of signals of product and of product plus substrate on substrate concentration. Results were compared with parallel measurement using spectrophotometric metod utilizing coupled reaction with horseradish peroxidase and guiacol and discussed with data from literature and BRENDA database. The tested method provides data, that are precise, but may not be accurate. The order of measured Km values was on par with lower ends of ranges found in literature. Values were lower than those measured using spectrophotometric method. Improvement of method was suggested. Advantages of this method include low sample ammount requirements, low cost of consumables and compared to methods using MALDI ToF of small molecules without the use of cetrimonium bromide no specific matrix to analyte ratio requirements. Disadvantages include, that the method is based on relative quantification and may produce skewed results at high substrate concentrations.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.