Počet záznamů: 1  

Studium enzymů metabolizujících ornitin

  1. Údaje o názvuStudium enzymů metabolizujících ornitin [rukopis] / Jan Tancer
    Další variantní názvyStudium enzymů metabolizujících ornitin
    Osobní jméno Tancer, Jan, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názStudy of enzymes metabolizing ornithine
    Vyd.údaje2023
    Fyz.popis79 s
    PoznámkaVed. práce David Kopečný
    Oponent Jan Frömmel
    Dal.odpovědnost Kopečný, David (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Frömmel, Jan (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Acetylace * acetyltransferasa * enzym * ornitin * transaminasa * Acetylation * acetyl transferase * enzyme * ornithine * transaminase
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiochemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00279169-330854428.pdf82.3 MB25.04.2023
    PosudekTyp posudku
    00279169-ved-389794129.pdfPosudek vedoucího
    00279169-opon-265284646.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00279169-prubeh-762956262.pdf14.10.202125.04.202323.05.2023CHodnocení známkou
    Ostatní přílohyVelikostPopis
    00279169-other-575656331.pdf138.3 KB

    Acetylace je enzymaticky katalyzovaná reakce modulující širokou škálu molekulárně-biologických dějů. S acetylací je spojeno značné množství biomakromolekul i nízkomolekulárních sloučenin, jako například aminokyseliny či polyaminy. Tato diplomová práce je zaměřena na expresi rekombinantních enzymů N-acetylaminotransferasy (NATA) a ornitin-delta-aminotransferasy (OAT) z kukuřice seté (Zea mays) a následnou charakterizaci ZmOAT. NATA katalyzuje acetylaci aminoskupiny ornitinu v pozici N2, zatímco OAT katalyzuje transaminaci aminoskupiny v pozici N5, za vzniku glutamát-5-semialdehydu. Oba geny kódující ZmNATA a ZmOAT byly úspěšně klonovány a exprimovány v buňkách E. coli. Byla provedena optimalizace exprese rekombinantních proteinů, které byly následně vypurifikovány. Stabilita enzymu byla měřena pomocí nanodiferenciální skenovací fluorimetrie. U ZmOAT byla studována možnost přeměny N2-acetylornitinu na N2-acetylglutamát-5-semialdehyd. Vznik produktů reakce OAT s ornitinem byl potvrzen spřaženou reakcí s kukuřičnou glutamát-semialdehyddehydrogenasou (aldehyddehydrogenasou12, ZmALDH12). Byla provedena fylogenetická analýza rodiny OAT. S využitím technik molekulárního modelování byla studována možnost vazby acetylovaného substrátu v aktivním místě OAT.Acetylation is an enzymatically catalyzed reaction that modulates a wide range of molecular biological processes. A significant number of biomacromolecules and low molecular weight compounds, such as amino acids and polyamines, are associated with acetylation. This thesis focuses on the expression of the recombinant enzymes N-acetyl aminotransferase (NATA) and ornithine--aminotransferase (OAT) from maize (Zea mays) and the subsequent characterization of ZmOAT. NATA catalyzes the acetylation of the ornithine amino group at the N2 position, whereas OAT catalyzes the transamination of the amino group at the N5 position, to form glutamate-5-semialdehyde. Both genes encoding ZmNATA and ZmOAT were successfully cloned and expressed in E. coli cells. The expression of the recombinant proteins was optimized and they were subsequently purified. The stability of the enzymes was measured by nanodifferential scanning fluorimetry. The possibility of converting N2-acetylornithine to N2-acetylglutamate-5-semialdehyde was studied for ZmOAT. The formation of the OAT reaction products with ornithine was confirmed by coupled reaction with maize glutamate-semialdehyde dehydrogenase (aldehyde dehydrogenase12, ZmALDH12). A phylogenetic analysis of the OAT family was performed. The possibility of acetylated substrate binding in the active site of OAT was studied using molecular modeling techniques.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.