Počet záznamů: 1
Mapování struktur současných chemických látek
Údaje o názvu Mapování struktur současných chemických látek [rukopis] / Jan Macháň Další variantní názvy Mapování struktur současných chemických látek Osobní jméno Macháň, Jan, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Mapping of current chemical scaffolds Vyd.údaje 2021 Fyz.popis 62 : il., tab. Poznámka Oponent Tomáš Kühr Ved. práce Karel Berka Dal.odpovědnost Kühr, Tomáš (oponent) Berka, Karel, 1982- (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova bioinformatika * molekulová struktura * scaffold * geografie chemie * Python workflow * mapování * bioinformatics * molecular structure * scaffold * geography of chemistry * Python workflow * mapping Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biochemie Studijní obor Bioinformatika kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00276759-724331862.pdf 16 2.8 MB 20.05.2021 Posudek Typ posudku 00276759-ved-280744434.pdf Posudek vedoucího 00276759-opon-735351612.pdf Posudek oponenta
Pojem scaffold se stává prominentním nástrojem v analýze velkých chemických dat, zejména pak v oblasti medicinální chemie. V této práci je popsán princip scaffoldu, jeho možné definice a využití v současných vědeckých článcích. Následně je provedena analýza využívající definici takzvaného Bemis-Murcko scaffoldu. V analýze jsou posléze chemická data získaná z databáze ChEMBL přiřazena státům světa s pomocí informací získaných prostřednictvím rozhraní PubMed. Zpracování dat a samotné mapování probíhá prostřednictvím několika workflow naprogramovaných v jazyce Python. Kód těchto workflow je detailně popsán a vysvětlen v této práci.The concept of scaffolds is a very prominent tool in analysing big chemical datasets, notably popular in medicinal chemistry. The concept itself as well as some of its possible definitions and most recent papers using it is described in this thesis. This analysis uses Bemis-Murcko scaffold definition. Mapping of dataset originating from the ChEMBL database with help of PubMed is performed. Data is processed and analysed using workflows written in Python which are described in this thesis.
Počet záznamů: 1