Cílem této bakalářské práce byla optimalizace parametrů hmotnostního spektrometru pro analýzu prekurzorových iontů následujících monolignolů: p-kumarylalkohol, koniferylalkohol a sinapylalkohol, které byly po separaci analyzovány pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie s využitím průtokové injekční analýzy. V získaných spektrech byly identifikovány fragmentační produkty a hledány společné trendy a rozdíly ve fragmentačních procesech jednotlivých monolignolů.The aim of this bachelor thesis was optimization of parameters of a mass spectrometer for the analysis of precursor ions of following monolignols: p-coumaryl alcohol, coniferyl alcohol and sinapyl alcohol, which were analyzed after separation by tandem mass spectrometry utilizing flow-injection analysis. Fragmentation products were identified in measured MS/MS spectra and common trends and differences in the fragmentation processes of individual monolignols were studied.