Počet záznamů: 1
Mapping of protein non-coding functional regions of the barley genome using epigenetic feature profiling
Údaje o názvu Mapping of protein non-coding functional regions of the barley genome using epigenetic feature profiling [rukopis] / Jana Vyroubalová Další variantní názvy Mapování protein nekódujících funkčních oblastí genomu ječmene využitím profilování epigenetických znaků Osobní jméno Vyroubalová, Jana, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Mapping of protein non-coding functional regions of the barley genome using epigenetic feature profiling Vyd.údaje 2022 Fyz.popis xiv s., 52 s. (96 351 znaků) Poznámka Oponent Aleš Pečinka Ved. práce Pavla Navrátilová Dal.odpovědnost Pečinka, Aleš, (oponent) Navrátilová, Pavla, (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra buněčné biologie a genetiky (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova barley * epigenetics * histones * post-translational histone modifications * ChIP-seq * ATAC-seq * enhancers * promoters * ječmen * epigenetika * histony * post-translační histonové modifikace * ChIP-seq * ATAC-seq * enhancery * promotory Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. angličtina Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Molekulární a buněčná biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00271798-546127373.pdf 19 3.5 MB 29.04.2022 Posudek Typ posudku 00271798-ved-937004085.pdf Posudek vedoucího 00271798-opon-819679482.pdf Posudek oponenta
The theoretical part of this thesis contains a comprehensive literature review incorporating key information on barley plants and epigenetics, with emphasis on enhancers and histone modifications. It also describes how to study epigenetic landscapes, primarily the ATAC-seq and the histone marker ChIP-seq methods. In the experimental part of this work, barley embryos 8 days after pollination (DAP), 24 DAP and 4 days after germination (DAG) seedlings were collected and subjected to ChIP-seq and ATAC-seq analysis. Sequencing data processing and analysis followed using bioinformatical tools.Teoretická část této diplomové práce obsahuje literární přehled zahrnující klíčové informace, které se týkají ječmene a epigenetiky, zejména informace o enhancerech a histonových modifikacích. Metody využívané k epigenetickému profilování, především ATAC-seq a ChIP-seq pro post-translační histonové modifikace, jsou taktéž popsány. Experimentální část je zaměřena na studium třech stádií ječmene - embryí 8 a 24 dní po opylení a 4denních klíčků. Tyto tkáně byly podrobeny ATAC-seq a ChIP-seq analýze. Sekvenační data byla zpracována a analyzována za pomoci bioinformatických nástrojů.
Počet záznamů: 1