Počet záznamů: 1
N-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens
Údaje o názvu N-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens [rukopis] / Jan Tancer Další variantní názvy N-acetylaminotransferasa z mechu Physcomitrella patens Osobní jméno Tancer, Jan, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz N-acetylaminotransferase from moss Physcomitrella patens Vyd.údaje 2021 Fyz.popis 67 Poznámka Oponent Lenka Luhová Ved. práce David Kopečný Dal.odpovědnost Luhová, Lenka (oponent) Kopečný, David (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova acetylace * heterologní exprese * Physcomitrella patens * polyaminy * transferasa * acetylation * heterologous expression * Physcomitrella patens * polyamines * transferase Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biochemie Studijní obor Biochemie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00271350-320882263.pdf 25 2.5 MB 11.05.2021 Posudek Typ posudku 00271350-ved-461612315.pdf Posudek vedoucího 00271350-opon-288872548.pdf Posudek oponenta
Tato bakalářská práce je věnována N-acetylaminotransferase (NATA) z mechu Physcomitrella patens. V teoretické části je popsán metabolismus polyaminů, jejich syntéza a degradace se zaměřením na acetylaci a známé enzymy u rostlin a savců. V experimentální části byl klonován gen PpNATA do expresního vektoru pET-28a. Expresí genu v buňkách E.coli byl získán rekombinantní protein obsahující histidinovou kotvu umožňující purifikaci afinitní chromatografií. Pomocí metody SDS-PAGE byla ověřena produkce proteinu, čistota a metodou nano-diferenciální skenovací fluorimetrie bylo ověřena stabilita proteinu a stabilizace vazbou na acetyl-CoA. Pomocí bioinformatických postupů byla predikována sekundární a terciární struktura proteinu na základě dostupných struktur savčí N-acetylaminotransferasy a dále bylo analyzováno vazebné místo pro vazbu acetyl-CoA v modelu PpNATA.This bachelor thesis is focused on the N-acetyl aminotransferase (NATA) from the moss Physcomitrella patens. The theoretical part describes the metabolism of polyamines, their synthesis and degradation with a focus on acetylation and known enzymes in plants and mammals. In the experimental part, the PpNATA gene was cloned into the expression vector pET-28a. The gene was expressed in E. coli cells yielding a recombinant protein comprising a histidine-tag allowing the affinity chromatography purification. The protein production and purity were verified by SDS-PAGE, and protein stability and the effect of acetyl-CoA binding was analyzed by the nano-differential scanning fluorimetry. Bioinformatic approaches were used to predict the secondary and tertiary structure of the protein was predicted based on the available structural data of N-acetyl aminotransferases, and the binding site for acetyl-CoA in the PpNATA model was further analyzed.
Počet záznamů: 1