Počet záznamů: 1  

Identifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie

  1. Údaje o názvuIdentifikace peptidů navázaných na MHC I molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie [rukopis] / Lubomír Machalla
    Další variantní názvyIdentifikace peptidů navázaných na MHCI molekulách pomocí hmotnostní spektrometrie
    Osobní jméno Machalla, Lubomír, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názIdentification of MHCI bound peptides using a mass spectrometry
    Vyd.údaje2022
    Fyz.popis64 : il., grafy, schémata, tab.
    PoznámkaVed. práce Kateřina Zachová
    Oponent Ján Gurský
    Dal.odpovědnost Zachová, Kateřina, (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Gurský, Ján (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Dendritické buňky * Spike protein * receptor vázající doména * hlavní histokompatibilní komplex * peptid * hmotnostní spektrometrie * Dendritic cells * Spike protein * receptor binding domain * major histocompatibility complex * mass spectrometry * peptide
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiochemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00271348-331749280.pdf472 MB26.04.2022
    PosudekTyp posudku
    00271348-ved-259316585.pdfPosudek vedoucího
    00271348-opon-588281765.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00271348-prubeh-183515587.pdf19.10.202026.04.202223.05.20221Hodnocení známkou

    Dendritické buňky jsou buňky imunitního systému, které propojují jeho vrozenou a získanou část. Patří mezi tzv. profesionální antigen prezentující buňky, které dokáží pohltit antigen pomocí fagocytózy a následně takový antigen rozložit na peptidové fragmenty. Tyto fragmenty poté dendritická buňka vystavuje na svém povrchu pomocí MHC molekul. V rámci diplomové práce byla věnována pozornost MHC I molekule a peptidům nacházejícím se na této molekule. K dendritickým buňkám byl přidán rekombinantní RBD protein pocházející z viru SARS-CoV-2. Pomocí imunoafinitní chromatografie byl komplex MHC I - peptid izolován z buněčného lyzátu. Následovalo štěpení komplexu MHC I - peptid trypsinem a kapalinová chromatografie, kde byly odseparovány jednotlivé peptidy. Identifikace peptidů byla provedena pomocí hmotnostní spektrometrie. Celkově analýza byla provedena 3x z důvodu optimalizace metody. Získané aminokyselinové sekvence peptidů byly následně porovnány pomocí databáze UniProt.Dendritic cells are cells of the immune system that connect its innate and adaptive parts. Dendritic cells belong to the group called professional antigen-presenting cells, which can absorb the antigen by phagocytosis and subsequently break down the antigen into peptide fragments. These fragments are then displayed on the cell surface using MHC molecules. Within the diploma thesis, attention was paid to the MHC I molecule and peptides bound on this molecule. To the dendritic cells was added recombinant RBD protein derived from SARS-CoV-2. The MHC I - peptide complex was isolated from the cell lysate by immunoaffinity chromatography. After that complex MHC I - peptide was digested by trypsin and peptides from the complex were separated by liquid chromatography. To the identification of peptides was used mass spectrometry. The analysis was performed 3 times to optimize the method. The obtained amino acid peptide sequences were compared using the UniProt database.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.