Počet záznamů: 1  

Analýza genu VRN-1 u pšenice seté (Triticium aestivum)

  1. Údaje o názvuAnalýza genu VRN-1 u pšenice seté (Triticium aestivum) [rukopis] / Dominik Grebík
    Další variantní názvyAnalýza genu VRN-1 u pšenice seté (Triticum aestivum)
    Osobní jméno Grebík, Dominik, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názAnalysis of VRN-1 gene in bread wheat (Triticum aestivum)
    Vyd.údaje2021
    Fyz.popis76 + CD-ROM
    PoznámkaVed. práce Jan Šafář
    Oponent Miroslav Valarik
    Dal.odpovědnost Šafář, Jan (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Valarik, Miroslav (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Centrum regionu Haná (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova vernalizace * VRN-A1 * sekvenování * CNV * vernalization * VRN-A1 * sequencing * CNV
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiotechnologie a genové inženýrství
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00254393-322268480.pdf491.7 MB26.04.2021
    PosudekTyp posudku
    00254393-ved-383405747.pdfPosudek vedoucího
    00254393-opon-522194849.pdfPosudek oponenta

    Teoretická část diplomové práce se nejprve zabývá pšenicí setou - Triticum aestivum L., její evolucí a významem pro lidstvo. Dále jsou v teoretické část uvedeny informace o genech ovlivňující kvetení u obilovin, jsou zde popsány zejména geny fotoperiodické a vernalizační dráhy, a také geny ranosti per se. Zvláštní pozornost je věnována genům vernalizační dráhy. Experimentální část této práce je rozdělena na dvě části. V první části je popsána analýza exprese genu VRN-A1. Je zde uvedena postupná selekce z původních 43 odrůd vybraných pro tuto analýzu, jejich alelická specifikace vedoucí k postupnému vyselektování odrůd splňujících podmínky kladené v cílech práce - stejná sestava alel VRN-A1, různý počet kopií genu VRN-A1. U těchto odrůd je následně analyzována exprese genu VRN-A1 pomocí RT-qPCR. Jsou zde také výsledky z fenotypové analýzy metání. Ve druhé části experimentální práce se nachází výsledky ze sekvenování genu VRN-1 metodou Sangerova sekvenování a Illumina iSeq. Z výsledků v této práci vyplývá, že odrůda Branišovická nesoucí dvě kopie alely Vrn-A1a metala signifikantně později než odrůda Bastion mající jednu kopii tohoto genu, rozdíly byly pozorovatelné i na úrovni exprese - v případě odrůdy s jednou kopií exprese v čase stoupala, v případě odrůdy s 2 kopiemi alely Vrn-A1a docházelo ke stagnaci nebo poklesu exprese VRN-A1. V rámci sekvenování byly u 8. exonu VRN-D1 u dvou odrůd identifikovány SNP, dále pak delece v tomtéž genu a taktéž delece v promotoru VRN-A1.The theoretical part of the master´s thesis first deals with bread wheat - Triticum aestivum L., its evolution and significance for humanity. Furthermore, the theoretical part contains information about genes influencing flowering in cereals, there are mainly described genes of the photoperiodic and vernalization pathway, as well as genes of early earliness per se. Special attention is paid to the genes of the vernalization pathway. The experimental part of this thesis is divided into two parts. The first part describes the analysis of VRN-A1 gene expression. There is a gradual selection from the original 43 varieties selected for this analysis, their allelic specification leading to the gradual selection of varieties meeting the conditions set in the objectives - the same set of VRN-A1 alleles, different copy number of VRN-A1 gene. In these varieties, the expression of the VRN-A1 gene is analyzed by RT-qPCR. There are also results from the phenotypic analysis of heading. The second part of the experimental work contains the results of sequencing of the VRN-1 gene by Sanger sequencing and Illumina iSeq. The results of this work show that the Branišovická variety carrying two copies of the Vrn-A1a allele headed significantly later than the Bastion variety with one copy of this gene, differences were also observable at the expression level - in the case of the one copy copy it increased over time, in the case of varieties with 2 copies of the Vrn-A1a allele, VRN-A1 expression stagnated or decreased. As part of the sequencing, SNPs were identified in exon 8 of VRN-D1 in two varieties, as well as deletions in the same gene and deletions in the VRN-A1 promoter.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.