Teoretická část se zabývá vlastnostmi nanoklastrů, strategiemi jejich přípravy a metodami, které slouží pro jejich charakterizaci. Závěr teoretické části je věnován elektroforéze v polyakrylamidovém a agarózovém gelu a její možností využití pro nanoklastry. Experimentální část byla zaměřena na přípravu zlatých nanoklastrů a jejich nanokompozitů obsahující atomy stříbra, železa nebo jejich kombinaci v přítomnosti proteinu hovězího sérového albuminu. Pro charakterizaci připravených systémů byla změřena UV/Vis spektra a excitačně-emisní spektra. Bylo připraveno pět prostředí lišících se ve složení, která se běžně používají jako nanášecí pufry pro vzorky v elektroforéze. Jejich vliv na připravené systémy byl sledován měřením cirkulárního dichroismu, dynamického rozptylu světla a zeta potenciálu. Bylo provedeno několik variant elektroforézy v agarózovém gelu, přičemž byly nanášeny připravené systémy v rozdílných prostředích. Nejvýraznější zóny systémů byly získány ve 2% agarózovém gelu s elektroforetickým pufrem 2x TAE, kde nanášecí pufr obsahoval prostředí bez přítomnosti dodecylsíranu sodného.The theoretical part deals with properties of nanoclusters, strategies of their synthesis, and methods that serve for their characterization. The final part of the theory is dedicated to polyacrylamide and agarose gel electrophoresis and their possible usage for nanoclusters. The experimental part was focused on the preparation of gold nanoclusters and their derived nanocomposites, which containing atoms or a combination of silver or iron atoms in the presence of bovine serum albumin. Characterization of the as-prepared systems was obtained by UV/Vis and excitation-emission spectra. There were five environments with various compositions that are usually used as loading buffers for the electrophoresis samples. Their influence was observed by measuring circular dichroism, dynamic light scattering, and zeta potential. Several variants of agarose gel electrophoresis were performed, whereas the as-prepared systems were loading in the gel in different environments. The most significant bands of separated nanoclusters were obtained in 2% agarose gel with 2x TAE as an electrophoretic buffer there was used the loading buffer without sodium dodecyl sulfate.