Úvod: Idiopatické zánětlivé myopatie (IZM) jsou heterogenní skupina vzácných, získaných, potenciálně život ohrožujících, onemocnění, která jsou charakterizována imunitně zprostředkovaným poškozením příčně pruhovaných svalů spojeným s různým stupněm mimosvalového postižení. V etiopatogenezi IZM hraje roli vliv zevního prostřední a genetické rizikové faktory, na poškození svalů a dalších orgánů se podílí komplexní souhra složek přirozené i získané imunity a také další neimunitní procesy. Cíle práce: Práce se věnuje vlivu zevního prostředí a genetických rizikových faktorů, imunitním a neimunitním patogenetickým mechanismům a v poslední části jsou popsány výsledky léčby abataceptem, inhibitorem kostimulačních receptorů T lymfocytů. Výsledky: Prokázali jsme vzestup incidence imunitně zprostředkované nekrotizující myopatie, na které se podílí především nárůst počtu nemocných s pozitivitou anti-HMGCR protilátek. Popsali jsme asociaci genů HSPA1A a HSPA1B kódujících proteiny teplotního šoku HSP70 s rizikem přítomnosti autoimunitních revmatických chorob a u nemocných s IZM prokázali zvýšené extracelulární hladiny HSP70. Zjistili jsme, že u japonských nemocných je klinicky amyopatická dermatomyozitida asociována s jednonukleotidovým polymorfismem kódujícím protein tr-WDFY4 a že u evropských pacientů tato asociace není přítomná. Popsali jsme vzájemné vztahy mezi koncentracemi aktivačního faktoru B lymfocytů, titry anti-Jo-1 protilátek a hodnotami C-reaktivního proteinu u nemocných s IZM. Prokázali jsme zvýšenou expresi visfatinu a interleukinu 35 ve svalových biopsiích a korelaci jejich sérových hladin s některými parametry aktivity IZM. Zjistili jsme, že zvýšené hladiny proteinu S100A4 korelují s extramuskulární aktivitou onemocnění, a ne s přítomností malignity. Prokázali jsme zvýšené hladiny protein S100A11 u nemocných s IZM. Popsali jsme změny v regulačním systému aktivin A-myostatin-folistatin, které svědčí spíše pro kompenzační mechanismy než pro přímou roli v rozvoji poškození svalů. V klinickém hodnocení fáze IIb jsme prokázali vliv léčby abataceptem na klinickou aktivitu u nemocných s refrakterní IZM a zjistili, že poměr CD4/CD8 T-lymfocytů má vztah ke zlepšení svalové vytrvalosti po léčbě abataceptem. Závěr: Předložené výsledky rozšiřují znalosti studovaných mechanismů a molekul v patogenezi IZM.Introduction: Idiopathic inflammatory myopathies (IIM) are a heterogenous group of rare, acquired, potentially fatal diseases, characterized by immune mediated injury of skeletal muscles associated with various degree of extramuscular involvement. Enviromental and genetic risk factors play a role in etiopathogenesis of IIM, a complex interplay of innate and adaptive immunity with other non-immune mechanisms is responsible for damage of muscles and other organs. Objectives: This thesis explores the influence of environmental and genetic risk factors, immune and non-immune pathogenetic mechanisms and, in the last part, reports the results of treatment with abatacept, an inhibitor of T-cell co-stimulatory receptors. Results: We have documented an increasing incidence of immune mediated necrotizing myopathy, mainly due to a growing number of patients with anti-HMGCR positivity. We have reported an association of HSPA1A and HSPA1B genes coding heat shock proteins (HSP) 70 with a risk of autoimmune rheumatic diseases and report increased extracellular levels of HSP70 in patients with IIM. We have found an association of clinically amyopathic dermatomyositis with a single nucleotide polymorphism coding tr-WDFY4 protein in Japanese patients, which is absent in European patients. We have analyzed the relationships between levels of B cell activating factor, anti-Jo-1 antibodies and C-reactive protein in patients with IIM. We have reported increased expressions of visfatin and interleukin 35 in muscle biopsies and correlations of their serum levels with some measures of disease activity in IIM. We have discovered that elevated levels of S100A4 protein correlate with extramuscular activity and not with presence of neoplasia. We have reported increased levels of S100A11 protein in patients with IIM. We have described abberations in the activin A-myostatin-follistatin regulatory system suggesting compensatory mechanisms rather than direct incolvement in muscle damage. In a phase IIb clinical study we have shown an effect of treatment with abatacept on clinical activity in patients with treatment resistant IIM and we have discovered that CD4/CD8 T-cell ratio is associated with improvement of muscle endurance after abatacept therapy. Conclusion: The presented results improve understanding of the studied mechanisms and molecules in the pathogenesis of IIM.