Počet záznamů: 1
Plugin do nástroje PyMOL
Údaje o názvu Plugin do nástroje PyMOL [rukopis] / Anna Špačková Další variantní názvy Plugin do nástroje PyMOL Osobní jméno Špačková, Anna, (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz PyMOL Plugin Vyd.údaje 2020 Fyz.popis 62 s. : tab. + 1 textový sobor (*.txt), 2 dialogová okna (*.ui), 8 souborů s naprogramovaným kódem v jazyku Python (*.py) Poznámka Ved. práce Tomáš Kühr Oponent Marie Zgarbová Dal.odpovědnost Kühr, Tomáš (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Zgarbová, Marie (oponent) Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova bioinformatika * PyMOL * plugin * Python * algoritmus * nukleové kyseliny * DNA * RNA * dusíkatá báze * stohování bází * párování bází * strukturní motiv * bioinformatics * PyMOL * plugin * Python * algorithm * nucleic acids * DNA * RNA * nitrogenous bases * stacking * pairing bases * structure motif Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses MDT (043)378.22 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Bc. Studijní program Bakalářský Studijní program Biochemie Studijní obor Bioinformatika kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00263018-143639184.pdf 0 2.3 MB 31.12.2999 Posudek Typ posudku 00263018-ved-350651402.pdf Posudek vedoucího 00263018-opon-218266016.pdf Posudek oponenta Ostatní přílohy Velikost Popis 00263018-other-548387901.rtf 46.6 KB 00263018-other-646542477.zip 25.7 KB
Software PyMOL neumožňuje nějaké funkce, kvůli tomu jsou programovány dodatečné kódy zajišťující rozšiřující možnosti a funkce softwaru. V rámci této práce bude vytvořen vlastní plugin pro identifikaci párování (kanonického i nekanonického) a určení míry stackingu bází načtené DNA či RNA molekuly. Dále by měl modul umožnit na základě těchto dat identifikovat a vizualizovat strukturální motivy v načtené molekule, případně i vygenerovat 2D mapu sekundární struktury. V teoretické části budou popsány možnosti vytváření modulů a popsána struktura nukleových kyselin, kterými se práce zabývá.Software PyMOL does not aloww some features therefore, additional codes are programmed. In this aim will be explored and described the possibility of creating PyMOL plugins, hereafter will be described nucleic acids. After studying this issue, will be created plugin to identify the base pairing of the loaded DNA and RNA molecules. The module will alow identify and visualize structural motifs in the loaded molecule, eventually generate a 2D map of the secondary structure.
Počet záznamů: 1