Tato diplomová práce se zaměřuje na rod Aegilops, jeho genetickou příbuznost pšenici a evoluci genomů pšenice a Aegilops. Dále stručně popisuje metody křížení pšenice s cizím druhem, metody identifikace nepůvodních chromosomů a značení sond. Na konec popisuje princip identifikace tandemových repetic in silico, což sloužilo jako základ pro praktickou část. Praktická část se zabývá použítím nově identifikovaných randemových repetic jako prób u dvou diploidních druhů Ae. umbellulata a Ae. comosa, a také allotetraploidního hybrida Ae. biuncialis, jež nese stejné typy genomů. Na Ae. biuncialis bylá take provedena genomová in situ hybridizace na identifikaci genomového původu každého chromosomu. Ten samý experiment byl proveden na ampfiploidním hybridu pšenice a Ae. biuncialis, nicméně bez jakýhkoliv publikovatelných výsledků, a není tedy zahrnut v sekci Výsledky.This thesis focuses on the genus Aegilops, its genetic proximity to wheat and the evolution of wheat and Aegilops genomes. Furthermore, it briefly discusses methods of crossing wheat with alien species, alien chromosome identification and probe labelling. Lastly, it describes the process of in silico tandem repeat identification, which was the basis for the experimental part. The experimental part discusses use of newly identified tandem repeats as probes on two diploid species Ae. umbellulata and Ae. comosa, as well as on an allotetraploid hybrid Ae. biuncialis which shares their genome types. On Ae. biuncialis, genomic in situ hybridisation was also performed to identify the genomic origin of each chromosome. The same experiment has been performed on a Ae. biuncialis/Triticum amphiploid, however without any publishable results, therefore it is not included in the Results section.