Tato práce je zaměřena na tvorbu softwaru pro funkční anotaci jednonukleotidových polymorfismů a exportu proteinových sekvencí ovlivněných těmito DNA modifikacemi v podobě FASTA souboru. V práci je rovněž popsáno testování souboru na reálném datovém setu, který představují vzorky sekvenování sklerocii u dvou kmenů Claviceps purpurea (20.1 a Gal 404). Teoretická část práce je zaměřena na popis současných sekvenačních metod a rovněž popis datových formátů využívaných v průběhu bioinformatické analýzy. Praktická část práce je věnována vývoji softwaru prezentovaném v této práci a jeho následné testování na reálném datovém setu společně se srovnáním s dalším dostupným softwarem poskytujícím anotaci jednonukleotidových polymorfismů. Výsledky anotace jednonukleotidových polymorfismů získané pomocí tohoto testování ukázaly, že prezentovaný software dosahuje srovnatelných výsledků se softwarem ANNOVAR. Software navíc poskytuje možnost vytváření peptidových knihoven dále využitelných v proteomické analýze.Main goal of this thesis is development of software for annotating of single nucleotide polymorphisms and exporting of protein sequences, affected by these DNA modifications, in FASTA format. Thesis also contains description of software testing with real dataset on input. The dataset includes samples produced by sequencing two species of Claviceps purpurea (20.1 and Gal 404) sclerotia. Theoretical part focuses on the description of most used sequencing methods and specification of data formats, that are used in bioinformatics analysis. Practical part aims on description of development and testing of created software followed by comparation with different software ANNOVAR with similar functions. Results of single nucleotide polymorphisms annotation showed that created software output is similar to ANNOVARs output. Created software also provides the option of creating peptid libraries, that can be used in proteomics analysis.