Počet záznamů: 1  

Purifikace glutamylendopeptidasy II z filtrátu kultury Streptomyces griseus

  1. Údaje o názvuPurifikace glutamylendopeptidasy II z filtrátu kultury Streptomyces griseus [rukopis] / Anita Vašíčková
    Další variantní názvyPurifikace glutamylendopeptidasy II z filtrátu kultury Streptomyces griseus
    Osobní jméno Vašíčková, Anita (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názPurification of glutamyl endopeptidase II from culture filtrate of Streptomyces griseus
    Vyd.údaje2019
    PoznámkaVed. práce Marek Šebela
    Oponent Zbyněk Zdráhal
    Dal.odpovědnost Šebela, Marek, 1971- (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Zdráhal, Zbyněk, (oponent)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Streptomyces griseus * glutamylendopeptidasa II * pronasa * kapalinová chromatografie * hmotností spektrometrie * Streptomyces griseus * glutamyl endopeptidase II * pronase * liquid chromatography * mass spectrometry
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiochemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00227639-836932430.zip1417.3 MB02.05.2019
    PosudekTyp posudku
    00227639-ved-300465208.pdfPosudek vedoucího
    00227639-opon-382244133.pdfPosudek oponenta

    Proteolytické enzymy představují přibližně 2% celkových proteinů přítomných u každého typu organismu. Štěpí proteiny, nebo polypeptidové řetězce tak, že katalyzují exergonní hydrolýzu peptidové vazby. Využívají se pro proteomickou analýzu, při které je rozštěpení proteinu na menší fragmenty důležitým krokem. Zásadní skutečností je, aby vybraný enzym štěpil specificky u konkrétního aminokyselinového zbytku případně dvou-tří zbytků za vzniku dostatečně velkých fragmentů analyzovatelných hmotnostní spektrometrií. Cílem této práce bylo purifikovat co nejčistější glutamylendopeptidasu II z filtrátu kultury Streptomyces griseus (pronasy). Tento enzym přednostně štěpí peptidovou vazbu u karboxylu kyseliny glutamové, případně kyseliny asparagové. Nejdříve byla potvrzena přítomnost tohoto enzymu v pronase se současnou identifikací dalších proteinů obsažených ve filtrátu. V dalším experimentu se postupovalo podle protokolu Svendsen et al. (1991). Kombinací chromatografických materiálů s podobnými vlastnostmi materiálů použitých v článku se podařilo purifikovat zatím necharakterizovanou proteasu (UniProtKB - B1VQD5_STRGG), u které byly charakterizovány její vlastnosti hydrolýzy peptidové vazby. V dalších experimentech byly zvoleny různé kombinace chromatografických materiálů, kterými bylo získáno několik enzymových směsí obsahujících glutamylendopeptidasu II. Proteiny byly identifikovány pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie na přístroji MALDI TOF/TOF. Nejčistější směs obsahovala glutamylendopeptidasu II a streptogrisin A.Proteolytic enzymes represent approximately 2% of total proteins present in each type of organism. These proteases catalyze exergonic hydrolysis of the peptide bond and they are used in proteomic analysis to obtain specific peptide fragments. It is essential to cleave specifically at a particular amino acid residue or two-three other residues to produce optimal fragments that can be analyzed by mass spectrometry. The aim of this work was to purify the purest glutamyl endopeptidase II mixture from the filtrate of Streptomyces griseus (pronase). This enzyme is characterized by preference for glutamic acid, optionally aspartic acid. First, the presence of this enzyme in pronase was confirmed together with identification of other proteins contained in the filtrate. In second experiment, the protocol Svendsen et al.(1991) was followed. Due to combination of chromatographic materials with similar properties as used in the paper, we managed to purify a non-characterized protease (UniProtKB - B1VQD5_STRGG). Afterwards, specific cleavage preferences of this proteas were characterized. In further experiments, other combinations of chromatographic materials were applied to obtain several enzyme mixtures containing glutamyl endopeptidase II. Proteins were identified using MALDI TOF/TOF tandem mass spectrometry. The purest mixture contained glutamyl endopeptidase II and streptogrisin A.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.