Počet záznamů: 1  

Vliv empirického potenciálu na konformační chování molekul

  1. Údaje o názvuVliv empirického potenciálu na konformační chování molekul [rukopis] / Dominika Hanakovičová
    Další variantní názvyVliv empirického potenciálu na konformační chování molekul
    Osobní jméno Hanakovičová, Dominika, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názThe effect of empirical potential on the conformational properties of molecules
    Vyd.údaje2019
    Fyz.popis53 s. (77 500 znakov) + 1 CD
    PoznámkaOponent Vojtěch Mlýnský
    Ved. práce Marie Zgarbová
    Dal.odpovědnost Mlýnský, Vojtěch, (oponent)
    Zgarbová, Marie (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova molekulová dynamika * nukleové kyseliny * hybridy * silové pole * molecular dynamics simulation * nucleic acids * hybrids * force field
    Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses
    MDT (043)378.22
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.slovenština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulBc.
    Studijní programBakalářský
    Studijní programChemie
    Studijní oborNanomateriálová chemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00225047-188529662.docx3226.4 MB24.04.2019
    PosudekTyp posudku
    00225047-ved-934719519.pdfPosudek vedoucího
    00225047-opon-329125699.docxPosudek oponenta

    Cieľom tejto bakalárskej práce je posúdiť stabilitu a konformačné správanie hybridov nukleových kyselín v molekulárne dynamických simuláciách. Simulácie sú spracované v rôznych silových poliach, z nich niektoré vznikli iba v posledných rokoch a pre vybrané štruktúry zatiaľ neboli testované. Predmetom práce je predovšetkým štúdium vplyvu empirického potenciálu na štruktúrne vlastnosti hybridov a ich porovnanie s čistou formou nukleových kyselín a dostupnými experimentálnymi dátami. Analýza cukor-fosfátovej kostry a vybraných štruktúrnych parametrov je uskutočnená s cieľom zistiť, či je štruktúra hybridov bližšie k forme A-RNA nebo B-DNA.The aim of this bachelor thesis is to assess stability and conformational properties of hybrids of nucleic acids in molecular dynamics simulations. Simulations are carried out with various force fields, some of which have been modified in recent years and selected structures have not yet been tested with them. We are interested mainly in the effect of empirical potential on structural properties of hybrids and comparison of hybrids with pure forms of nucleic acids and with available experimental data. Sugar-phosphate backbone and selected structural parameters are examined with the aim to find out if hybrids are structurally closer to the A-RNA or B-DNA form.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.