Počet záznamů: 1  

Příprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4

  1. Údaje o názvuPříprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4 [rukopis] / Zuzana Koukalová
    Další variantní názvyPříprava zhrubeného modelu cytochromu P450 3A4
    Osobní jméno Koukalová, Zuzana, (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názPreparation of coarse-grained model of cytochrome P450 3A4
    Vyd.údaje2018
    Fyz.popis38 s. : il., grafy, schémata, tab. + CD ROM
    PoznámkaOponent Veronika Navrátilová
    Ved. práce Martin Šrejber
    Dal.odpovědnost Navrátilová, Veronika (oponent)
    Šrejber, Martin (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Cytochrom P450 * molekulová dynamika * zhrubený model * Cytochrome P450 * Molecular dynamics * Coarse-grain models
    Forma, žánr bakalářské práce bachelor's theses
    MDT (043)378.22
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulBc.
    Studijní programBakalářský
    Studijní programChemie
    Studijní oborAplikovaná chemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00230357-604168142.pdf72.6 MB20.08.2018
    PosudekTyp posudku
    00230357-ved-615975399.pdfPosudek vedoucího
    00230357-opon-411382679.pdfPosudek oponenta

    V této práci byly připraveny zhrubené modely systému cytochromu P450 3A4 na různých membránách složených z lipidů DOPC, DOPE a DOPG. Prostřednictvím molekulárně dynamických simulací za použití silového pole Martini byly nejdříve analyzovány strukturní parametry samotných membrán např. plocha, kterou zaujímá jeden lipid, tloušťka membrány či stupeň uspořádanosti lipidů. Poté bylo studováno chování na membráně kotveného cytochromu P450 3A4. Výsledky zhrubených simulací byly následně porovnány s atomistickými simulacemi a experimentálně dostupnými daty. Shoda zhrubených modelů s atomistickými simulacemi a experimenty potvrzuje vhodnost použití těchto modelů ke studiu biologických systémů.In this study we prepared coarse-grain models of membrane-bound cytochrome P450 3A4 on membrane of different lipid composition, such as DOPC, DOPE and DOPG. Using molecular dynamics techniques and Martini lipid force field we analyzed structural parameters of membranes such as area per lipid, bilayer thickness and order parameters. Then, behaviour of membrane attached cytochrome P450 was studied. Results obtained from coarse-grain simulations were compared to all-atom models and experimental data. The correlation between coarse-grain models, atomistic simulations and experiments proved that this approach is valid tool to study biological systems.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.