Rostlinné hormony auxiny se účastní mnoha procesů růstu a vývoje v rostlinách. Pro správné řízení těchto procesů je nezbytné utváření lokálních gradientů auxinu v rámci buněk i pletiv, které jsou regulovány především metabolismem a polárním transportem auxinu. Jedním z metabolických procesů je přeměna kyseliny indol-3-(yl)-octové (IAA) na její methylester (methylester kyseliny indol-3-(yl)-octové; MeIAA). V této práci byly provedeny experimenty optimalizující extrakci a purifikaci MeIAA z desetidenních semenáčků Arabidopsis thaliana. Získané výsledky pomohou při vývoji analytického protokolu pro kvantitativní analýzu MeIAA pomocí UHPLC-MS/MS.Plants hormones auxins are involved in many growth and development processes in plants. For correct control of these processes, it is necessary to create local gradients of auxins within cells and tissues, which are mainly regulated by metabolism and polar transport. One of metabolic processes is a conversion of indole-3-acetic acid into methyl ester (indole-3-acetic acid methyl ester; MeIAA). In this thesis was performed a set of experiments for optimization of extraction and purification of MeIAA from ten days old seedlings of Arabidopsis thaliana. Obtained results will be useful for development of analytical protocol for quantitative determination of MeIAA by UHPLC-MS/MS.