Většina léčiv dnes patří do skupiny malých molekul. Pro pochopení chování léčiv v těle je zásadní porozumění jejich průniku skrze biologické membrány, který je závislý na tom, jak daná molekula s membránou interaguje. Cílem této práce je návrh a následná tvorba online databáze, která bude shromažďovat informace o jednotlivých molekulách, modelových membránách, metodách a predikovaných a experimentálních hodnotách jednotlivých interakcí. Databáze je volně přístupná s propracovaným uživatelským rozhraním na adrese molmedb.upol.cz.Nowadays most drugs belong to the small molecules group. In order to understand the behavior of the drugs in human body, it is essential to thoroughly recognize the way they penetrate the biological membrane, which is dependent on the interaction between the molecule and the membrane. The aim of this thesis is the proposal and consequential creation of an online database, which will collect information about particular molecules, model membranes, methods and predicted and experimental values of individual interactions. The database is freely accessible with a sophisticated user interface at molmedb.upol.cz