Tato bakalářská práce se zabývá analýzou buněk za pomocí Ramanovy mikroskopie ve spojení s mikroskopií atomárních sil. Studium buněk a jejich povrchů je důležité pro pochopení buněčných mechanismů, které se odehrávají po vypuknutí onemocnění typu rakoviny. Mikroskopií atomárních sil byly zobrazeny povrchy buněk a jejich výškové profily a z těchto informací byly pozorovány rozdíly mezi zdravými a rakovinnými buňkami. Dále za pomocí Ramanovy spektroskopie byla naměřena spektra pro různá místa na zdravých buňkách. Z těchto spekter byly interpretovány typické pásy pro různé složky buňky, tzv. markery. Zřetelně byly pozorovány pásy pro proteiny a lipidy, o menší intenzitě také pro nukleové kyseliny. Tyto informace mohou být dále využity pro budoucí analýzu rakovinných buněk a pozorování změn v jejich struktuře.This bachelor thesis deals with cell analysis using the Raman and Atomic Force Microscopy. The study of cells and their surfaces is important for understanding cellular mechanisms that happen to appear after the disease such as cancer outbreak. The cell surfaces and their height profiles were measured by Atomic Force Microscope and differences between healthy and cancer cells were observed from this data. The Raman spectra on various places of a healthy cell were measured next. Typical bands which stand for different components of the cell were interpreted, the so-called markers. The bands of proteins and lipids were observed clearly, for nucleic acids with small intensity. This kind of information can be used later for further analysis of cancer cells and to observe changes in the structure between healthy and cancer cells.