B chromozomy jsou genetické elementy, které se vyskytují u poměrně velkého počtu eukaryotických organismů. Nejsou však přítomné u všech jedinců v rámci druhu a jejich počet se může lišit i mezi pletivy nebo jednotlivými buňkami daného organismu. Od A chromozomů se dále liší tím, že nepodléhají Mendelistické dědičnosti a následují svou vlastní evoluční dráhu. Ačkoliv jsou B chromozomy v posledních letech intenzivně studovány, původ a evoluce těchto elementů je stále poměrně nejasná. Tato bakalářská práce je součástí projektu, který se zabývá evolucí B chromozomu u kukuřice a jejích příbuzných druhů v rámci tribu Andropogoneae. V experimentální části práce byly navrhovány primery vhodné k amplifikaci ISBP markerů specifických pro B chromozomy kukuřice. Specificita navrhovaných primerů byla testována pomocí PCR reakcí s DNA vyizolovanou z rostlin kukuřice nesoucích B chromozomy a rostlin, které ve svém genomu B chromozom neobsahují. Ze 40 navržených primerů bylo 21 primerů specifických pro B chromozom. Získané ISBP markery byly následně zamapovány do šesti oblastí B chromozomu kukuřice, a to pomocí pěti translokačních linií, TB10L-20, TB10L-26, TB10L-38, TB10L 7 a TB10L-18, v nichž je část B chromozomu nahrazena částí dlouhého raménka chromozomu 10. Mapování markerů probíhalo pomocí PCR reakcí s DNA vyizolovanou z jedinců patřících k těmto translokačním liniím. Markery získané v této bakalářské práci zároveň významně rozšiřují počet existujících markerů specifických pro B chromozom u kukuřice a mohou být užitečné při jeho dalším studiu.B chromosomes are genetic elements which can be found in rather large amount of eukaryotic organisms. They are not found in every individual of the species and they amount varies even amongst meshes or cells of the organism. They do not subject the Mendelian heredity and follow their own evolutionary pathway, this is what makes them different from A chromosomes. Although B chromosomes has been intensively studied in the past few years the origin and evolution of those are still rather unknown. This bachelor´s thesis is a part of a project which follows up evolution of B chromosomes in maize and its relatives in tribe of Andropogonae. In the experimental part of this thesis primers suitable for amplification of ISBP markers specific for B chromosomes have been designed. Specificity of those primers has been tested by PCR reaction between DNA isolated from maize with B chromosomes and between plants with no B chromosomes. There have been 40 designed primers, 21 of them has been specific for B chromosomes. Obtained ISBP markers were mapped into 6 areas of the B chromosome of maize by 5 translocation lines TB10L-20, TB10L-26, TB10L-38, TB10L-7 and TB10L 18. In those part of B chromosome is replaced by the long arm of chromosome 10. The mapping of the markers has been done with the PCR reaction with DNA isolated from individuals belonging into those translocation lines mentioned before. Markers obtained in this thesis simultaneously significantly expand the amount of existing markers specific for B chromosomes of maize and can be used in further studies.