Za použití optimalizovaného protokolu pro mikroextrakci pevnou fází pomocí plněných pipetovacích špiček (SPE-PT) jsme stanovili profil indol-3-yloctové kyseliny (IAA) a jejích nejčastěji se vyskytujících metabolitů (IAA-aspartát, IAA-glutamát, IAA-glukóza, oxIAA-glukóza a oxIAA) v prýtu, primárním kořeni a segmentech primárního kořene Arabidopsis thaliana ekotypu Col-0. Dále byl testován vliv dioxygenasy pro oxidaci auxinu 2 (DAO2) u knockoutových linií dao2-1 a dao2-2 na profil IAA a jejích metabolitů oproti kontrolní linii Col-0. Hladiny sledovaných metabolitů a IAA byly stanoveny pomocí UHPLC-MS/MS. Získané výsledky poskytují důležité informace o metabolismu IAA a distribuci metabolitů v kořeni Arabidopsis thaliana.Using optimized protocol for solid phase micoextraction in pipette tips (SPE-PT) we determined profile of idole-3-acetic acid (IAA) and its metabolites (IAA-aspartate, IAA-glutamate, IAA-glucose, oxIAA-glucose and oxIAA) in shoots, primary root and root segments of Arabidopsis thaliana ecotype Col-0. Next we tested effect of dioxygenase for auxin oxidation 2 (DAO2) on IAA metabolite profile using knockout lines dao2-1 and dao2-2. Levels of IAA metabolites were determined using UHPLC-MS/MS. Obtained results provide us important informations about auxin metabolism and its distribution within primary root of Arabidopsis thaliana.