Počet záznamů: 1  

Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie

  1. Údaje o názvuNávrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie [rukopis] / Jan Pauswang
    Další variantní názvyNávrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie
    Osobní jméno Pauswang, Jan (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názDesign of macromolecular structures using computational methods
    Vyd.údaje2018
    Fyz.popis47
    PoznámkaOponent Karel Berka
    Ved. práce Petra Kührová
    Dal.odpovědnost Berka, Karel, 1982- (oponent)
    Kührová, Petra (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra fyzikální chemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova molekulová mechanika * molekulová dynamika * Amber * polymeráza * cytomegalovirus * model polymerázy * molecular mechanics * molecular dynamics * Amber * polymerase * cytomegalovirus * polymerase's model
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programChemie
    Studijní oborMateriálová chemie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00219971-398619167.docx13133.2 MB04.05.2018
    PosudekTyp posudku
    00219971-ved-196886021.pdfPosudek vedoucího
    00219971-opon-614890374.docxPosudek oponenta

    Práce se zabývá vytvořením modelů polymerázy cytomegaloviru. Při vytváření modelu byl pro návrh struktury použit program I-TASSER. Simulace modelů probíhaly pomocí výpočtů založených na principech molekulové mechaniky v programu Amber. Templáty, na jejichž základě byly pomocí programu I-TASSER vytvořeny modely polymerázy, odpovídaly kódům 2gv9, 3iay a 4flw v PDB databázi. Byly vytvořeny dva modely polymerázy cytomegaloviru obsahující DNA. Jeden model obsahoval DNA v exonukleázové formě. Druhý model obsahoval DNA v polymerázové formě.In this work the generating of model of polymerase of cytomegalovirus was studied. I-TASSER program was used to prediction of polymerase structure. Simulation of models were performed with program Amber using molecular mechanism principles. Structure of models is based on concrete structures of herpesvirus polymerase (2gv9), yeast (3iay) and archaebacteria (4flw). Models were prepared with DNA in two modes. First model was prepared with DNA in the polymerizing mode. Second model was prepared with DNA in editing mode.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.