Počet záznamů: 1
Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu
Údaje o názvu Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu [rukopis] / Lucie Kotková Další variantní názvy Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu Osobní jméno Kotková, Lucie (autor diplomové práce nebo disertace) Překl.náz Optimization of library technology for multi-parallel sequencing in the colorectal cancer diagnostics Vyd.údaje 2017 Fyz.popis 94 s. Poznámka Oponent Jiří Drábek Ved. práce Rastislav Slavkovský Dal.odpovědnost Drábek, Jiří, 1969- (oponent) Slavkovský, Rastislav (vedoucí diplomové práce nebo disertace) Dal.odpovědnost Laboratoř růstových regulátorů (udelovatel akademické hodnosti) Klíč.slova kolorektální karcinom * sekvenování nové generace (NGS) * multiparalelní sekvenování * anti-EGFR terapie * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF * Colorectal carcinoma * next generation sequencing (NGS) * multi-parallel sequencing * anti-EGFR therapy * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF Forma, žánr diplomové práce master's theses MDT (043)378.2 Země vyd. Česko Jazyk dok. čeština Druh dok. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Titul Mgr. Studijní program Navazující Studijní program Biologie Studijní obor Experimentální biologie kniha
Kvalifikační práce Staženo Velikost datum zpřístupnění 00214592-874247090.pdf 0 34 B 31.12.2999 Posudek Typ posudku 00214592-ved-232787663.pdf Posudek vedoucího 00214592-opon-720427357.pdf Posudek oponenta Průběh obhajoby datum zadání datum odevzdání datum obhajoby přidělená hodnocení typ hodnocení 00214592-prubeh-960502145.pdf 22.08.2012 10.05.2017 08.06.2017 1 Hodnocení známkou
Personalizovaná terapie je pro pacienty s kolorektálním karcinomem velká naděje na prodloužení a zkvalitnění života. U pacientů indikovaných k léčbě inhibitory EGFR (cetuximab, panitumumab) je nezbytné znát mutační status genů KRAS a NRAS, které jsou markery negativní odpovědi na léčbu, a prognostického markeru BRAF. Komerčně dostupné diagnostické kity zaměřené na genotypizaci těchto genů založené na přístupech sekvenování nové generace se v současné době potýkají s dlouhým a finančně nákladným zpracováním jednoho vzorku. Příprava sekvenační knihovny probíhá typicky ve dvou až čtyřech krocích, což klade vyšší nároky na personál z hlediska času i rizika možných chyb. Nově vyvinutá metoda fastRAS umožňuje přípravu sekvenační knihovny v jednom kroku, je uživatelsky příjemnější, rychlejší než stávající metody, snižuje celkové náklady na genotypizaci jednoho vzorku a je dostatečně robustní pro zpracování bez nutnosti technických replikátů. Metoda prošla validací a byla akreditovaná pro diagnostickou praxi.Personalised therapy promises prolonged and better quality survival for patients with colorectal carcinoma. Mutation status of KRAS and NRAS genes is important in patients indicated for anti-EGFR treatment (cetuximab, panitumumab), because it predicts negative response to therapy. Mutational status of BRAF is considered to be a prognostic marker. Problems of commercialy available genotyping kits based on next generation sequencing approach are long and expensive processing of one sample. Peparation of sequencing library mostly takes from two to four steps which makes it time-consuming and it carries a high risk of possible mistakes. Newly developed fastRAS method enables one-step library preparation with less costs for genotyping one sample, it is more user friendly, faster comparing to standard methods and robust enough to process a sample without the need of technical replicates. The method had been validated and accredited for diagnostics.
Počet záznamů: 1