Počet záznamů: 1  

Optimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu

  1. Údaje o názvuOptimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu [rukopis] / Lucie Kotková
    Další variantní názvyOptimalizace přípravy knihoven pro multiparalelní sekvenování v diagnostice kolorektálního karcinomu
    Osobní jméno Kotková, Lucie (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názOptimization of library technology for multi-parallel sequencing in the colorectal cancer diagnostics
    Vyd.údaje2017
    Fyz.popis94 s.
    PoznámkaOponent Jiří Drábek
    Ved. práce Rastislav Slavkovský
    Dal.odpovědnost Drábek, Jiří, 1969- (oponent)
    Slavkovský, Rastislav (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Laboratoř růstových regulátorů (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova kolorektální karcinom * sekvenování nové generace (NGS) * multiparalelní sekvenování * anti-EGFR terapie * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF * Colorectal carcinoma * next generation sequencing (NGS) * multi-parallel sequencing * anti-EGFR therapy * cetuximab * panitumumab * KRAS * NRAS * BRAF
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiologie
    Studijní oborExperimentální biologie
    kniha

    kniha

    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00214592-874247090.pdf034 B31.12.2999
    PosudekTyp posudku
    00214592-ved-232787663.pdfPosudek vedoucího
    00214592-opon-720427357.pdfPosudek oponenta
    Průběh obhajobydatum zadánídatum odevzdánídatum obhajobypřidělená hodnocenítyp hodnocení
    00214592-prubeh-960502145.pdf22.08.201210.05.201708.06.20171Hodnocení známkou

    Personalizovaná terapie je pro pacienty s kolorektálním karcinomem velká naděje na prodloužení a zkvalitnění života. U pacientů indikovaných k léčbě inhibitory EGFR (cetuximab, panitumumab) je nezbytné znát mutační status genů KRAS a NRAS, které jsou markery negativní odpovědi na léčbu, a prognostického markeru BRAF. Komerčně dostupné diagnostické kity zaměřené na genotypizaci těchto genů založené na přístupech sekvenování nové generace se v současné době potýkají s dlouhým a finančně nákladným zpracováním jednoho vzorku. Příprava sekvenační knihovny probíhá typicky ve dvou až čtyřech krocích, což klade vyšší nároky na personál z hlediska času i rizika možných chyb. Nově vyvinutá metoda fastRAS umožňuje přípravu sekvenační knihovny v jednom kroku, je uživatelsky příjemnější, rychlejší než stávající metody, snižuje celkové náklady na genotypizaci jednoho vzorku a je dostatečně robustní pro zpracování bez nutnosti technických replikátů. Metoda prošla validací a byla akreditovaná pro diagnostickou praxi.Personalised therapy promises prolonged and better quality survival for patients with colorectal carcinoma. Mutation status of KRAS and NRAS genes is important in patients indicated for anti-EGFR treatment (cetuximab, panitumumab), because it predicts negative response to therapy. Mutational status of BRAF is considered to be a prognostic marker. Problems of commercialy available genotyping kits based on next generation sequencing approach are long and expensive processing of one sample. Peparation of sequencing library mostly takes from two to four steps which makes it time-consuming and it carries a high risk of possible mistakes. Newly developed fastRAS method enables one-step library preparation with less costs for genotyping one sample, it is more user friendly, faster comparing to standard methods and robust enough to process a sample without the need of technical replicates. The method had been validated and accredited for diagnostics.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.