Tato diplomová práce v teoretické části pojednává o sekundárních metabolitech v konopí setém a jejich analýze v rostlinném materiálu. Experimentální část je zaměřena na stanovení kanabinoidů validovanou metodou kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí. Této metody je využito pro stanovení kanabinoidů ve vybraných technických odrůdách konopí setého. Zároveň je tato metoda srovnána s metodou plynové chromatografie s plamenoionizační detekcí a s metodou plynové chromatografie s hmotnostní detekcí.This master thesis in theoretical part deal with secondary metabolites in Cannabis sativa and their analysis in plant material. Experimental part is focused on determination of cannabinoids by validated method of liquid chromatography with mass spectrometry. This method is used for determination of cannabinoids in selected technical varieties of Cannabis sativa. Second point of this part is comparison of LC-MS method with gas chromatography with flame ion detection and gas chromatogrpahy coupled with mass spectrometry.