Počet záznamů: 1  

Kvasinkové rekombinační klonování a jeho využití pro přípravu konstruktů k transformaci Claviceps purpurea, funkční ověření vybraných konstruktů

  1. Údaje o názvuKvasinkové rekombinační klonování a jeho využití pro přípravu konstruktů k transformaci Claviceps purpurea, funkční ověření vybraných konstruktů [rukopis] / Michaela Hradilová
    Další variantní názvyKvasinkové rekombinační klonování a jeho využití pro přípravu konstruktů k transformaci Claviceps urpurea, funkční ověření vybraných konstruktů
    Osobní jméno Hradilová, Michaela (autor diplomové práce nebo disertace)
    Překl.názYeast recombinational cloning ant its use for construct preparation to transform Claviceps purpurea, functional testing of selected constructs
    Vyd.údaje2016
    Fyz.popis92 s. (179 505 znaků)
    PoznámkaOponent Veronika Smékalová
    Ved. práce Josef Vrabka
    Dal.odpovědnost Smékalová, Veronika (oponent)
    Vrabka, Josef (vedoucí diplomové práce nebo disertace)
    Dal.odpovědnost Univerzita Palackého. Katedra biochemie (udelovatel akademické hodnosti)
    Klíč.slova Kvasinkové rekombinační klonování * Claviceps purpurea * lysergylpeptidová synthetasa LPS1 * Yeast recombinational cloning * Claviceps purpurea * lysergylpeptide synthetase LPS1
    Forma, žánr diplomové práce master's theses
    MDT (043)378.2
    Země vyd.Česko
    Jazyk dok.čeština
    Druh dok.PUBLIKAČNÍ ČINNOST
    TitulMgr.
    Studijní programNavazující
    Studijní programBiochemie
    Studijní oborBiochemie
    Kvalifikační práceStaženoVelikostdatum zpřístupnění
    00193684-114657931.pdf1172.1 MB22.04.2016
    PosudekTyp posudku
    00193684-ved-144462863.pdfPosudek vedoucího
    00193684-opon-123189569.pdfPosudek oponenta
    SignaturaČár.kódLokaceDislokaceInfo
    DP-KBC/247 (PřF-KBO)3134520328PřF-HolicePřF, Knihovna Holice - skladpouze prezenčně

    Claviceps purpurea je fytopatogenní houba parazitující na více než 400 rostlinných druzích, zejména žitě, ječmeni a prosu. V infikovaných květenstvích se vytváří tzv. námel, sklerocium s vysokým obsahem námelových alkaloidů. Tyto alkaloidy jsou využívány ve farmaceutickém průmyslu. Pro studium C. purpurea byla v minulosti zavedena metoda genetické transformace. Experimentální přístupy byly navíc usnadněny nedávným sekvenováním genomu C. purpurea 20.1. Vhodnou technikou pro přípravu konstruktů k transformaci C. purpurea je kvasinkové rekombinační klonování, které představuje cenově dostupnou, jednoduchou a vysoce účinnou alternativou klasického klonování. Připravené konstrukty mohou navíc obsahovat fluorescenční značku, tudíž mohou být použity k lokalizaci proteinů, studiu proteinových interakcí či sledování průběhu infekce v hostitelské tkáni. Tato práce je zaměřena na optimalizaci a využití metody kvasinkového rekombinačního klonování k přípravě konstruktů pro transformací C. purpurea. Touto metodou byly připraveny konstrukty pro expresi i deleci vybraných genů C. purpurea. Konstrukty pro expresi genu lpsA1, který kóduje neribosomální lysergylpeptidovou synthetasu LPS1, byly transformovány do dvou kmenů C. purpurea. Pro ověření jejich přítomnosti a funkčnosti byly zvoleny metody diagnostické PCR, qPCR a Western blotu. Metodou epifluorescenční mikroskopie byla určena lokalizace GFP fúzního proteinu. Transformanti byly společně s odpovídajícími kontrolami infikováni na žito. Získaná sklerocia budou testována na změnu v obsahu produkovaných námelových alkaloidů.Claviceps purpurea is a phytopathogenic fungus which infects more than 400 plant species, especially rye, barley and millet. Late stage of infection is characteristic by formation of ergot, a sclerotium with high content of ergot alkaloids. These alkaloids are widely used in pharmaceutical industry. For study of C. purpurea a method of genetic transformation was impemented in the past. Moreover experimental approaches were facilitated by the recent sequencing of the genome of C. purpurea 20.1. The yeast recombinational cloning that represents an affordable, simple and highly effective alternative to classical cloning is a suitable technique for constructs preparation to transform this fungi. Furthermore the prepared constructs may contain a fluorescent label, therefore they can be used to localize protein of interest, study of protein interactions or monitoring the path of infection in the host tissue. This work is focused on optimizing and utilization of yeast recombinational cloning for preparation of constructs to transform C. purpurea. Using this method constructs for expression and deletion of selected C. purpurea genes have been prepared. The constructs for expression of lpsA1 gene which encodes a nonribosomal lysergylpeptide synthetase LPS1 have been transformed into two strains of C. purpurea. Methods of diagnostic PCR, qPCR and Western blot were chosen to verify their presence and functionality. Using epifluorescence microscopy the localization of GFP fusion protein was done. Transformants and the corresponding controls were infected on rye. Sclerotia will be tested for alternation in content of produced alkaloids.

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.